【罗工秘籍24】 Flowjo批量导出数据竟如此简单！

本期罗工秘笈给大家详解一下如何将Flowjo中分析的数据进行批量导出，方便进行二次加工。

Flowjo是分析流式数据的第三方专业软件，通常除了Gating subset之外，我们还需要用到它的作图和统计百分比的功能。




也就是Layout editor（图形制作） 和Table editor（数据统计）功能。而今天，我们着重要讲解的是Table editor（数据统计）功能

 

该功能旨在帮助用户把批量圈门的原始数据导出成excel文件或可视化的结果，方便做二次分析和展示使用。

 

首先打开flowjo软件，导入原始数据并且进行初步的门分析

 

 

将分析的框架批量覆盖所有样本，批量圈门。

 

 

打开Table editor（数据统计）模块，将任意样本的门逻辑拖入Table editor框架中

 

 

在通道中标注一下圈门的命名（可选项）

 

 

如有需要可添加heat map效果（该效果仅体现在html中，excel无法导出此热图效果）

 

 

在导出选项中选择导出文件，选择excel即可

 

 

点击桌面上生成的xlsx文件，即可看到在该表中，表头是命名的细胞亚群，而首列是不同样本，最终得到的就是不同样本下，不同细胞亚群的的细胞亚群。

 

小Tips：默认导出的是百分比，如要添加的是mean/MFI值的话，也可以拉入table editor中哦！