大肠杆菌（E.coli）基因文库简介

Dharmacon自1995年成立以来，不断致力于基因调控产品的研发和创新，是高效干扰siRNA的设计者，也是RNAi技术领域专利技术和知识产权最大持有者。

Dharmacon与世界顶级研究机构合作，至今使用Dharmacon产品的CNS文章已超3000篇。目前，其研究领域和研究工具已扩展到基因调控的各个方面，如siRNA, shRNA, CRISPR各功能性筛选的全基因组文库。

此外，Dharmacon还收集了齐全的商业化cDNA和ORF文库，其中包括大肠杆菌（E.coli）基因敲除文库、启动子文库和大肠杆菌标记ORFs。

大肠杆菌取材广泛，分裂增殖能力强、发育周期短及结构简单等特点，已作为一种重要的模式生物在分子遗传学、生物工程领域发挥重要的作用。大肠杆菌基因文库有助于进一步了解基因调控、分子相互作用和基因功能分析的突变效应集合。

大肠杆菌（E.coli）文库分类与选择

Dharmacon提供多种大肠杆菌文库，包括大肠杆菌（E.coli）基因敲除文库、启动子文库和大肠杆菌标记ORFs，具体信息如下：

大肠杆菌基因敲除文库

（E. coli Keio Knockouts Collection）

大肠杆菌基因敲除文库包含E.coli K-12中所有非必需基因的单基因敲除突变体，是由日本科研机构（Advanced Biosciences, Keio University (Japan), Nara Institute of Science and Technology (Japan)）和普度大学合作研发的。该文库不仅是系统功能基因组学的资源，而且可作为一个反向遗传学方法的工具。与正向遗传学（突变体表型与相应的基因有关）相反，该文库是根据基因功能的完全丧失来分析相关表型的变化。

文库亮点：

（1）共计3985个基因，每个基因提供两个独立的缺失菌株，共7970个克隆；
（2）每个删除的基因均被卡那霉素抗性盒取代，该盒侧翼带有的FRT位点可被FLP重组酶识别并切除；
（3）菌株背景：E. coli K-12 BW25113，该菌株是最常用的大肠杆菌基因敲除背景原型株。

规格	货号
E. coli Keio Knockout Collection（文库）	OCE4988
E. coli Keio Knockout Strain（单克隆）	OCE4987
E. coli Keio Knockout Parent Strain BW25113（亲本株）	OCE5042

大肠杆菌启动子文库

该库由国外科研机构（Weizmann Institute of Science）研发，用于在活细胞中实时检测基因表达情况，每个报告菌株都有标记了明亮的、快速折叠绿色荧光蛋白（GFP），融合至低拷贝质粒的大肠杆菌启动子的全长拷贝上。

文库亮点

（1）绿色荧光报告菌株文库，用来检测大肠杆菌启动子活动；
（2）包含超过1900个启动子，背景菌株为：E. coli K12 strain MG1655；
（3）在全基因组范围内检测准确的启动子活动；
（4）在质粒水平上，所挑选的DNA区域很容易突变，能够验证启动子区域cis-regulatory位点。

规格	货号
E. coli Promoter Collection（文库）	PEC3877
E. coli Promoter Strain（单克隆）	PEC3876

大肠杆菌标记ORFs文库

（E. coli Tagged ORFs）

为了在大肠杆菌蛋白复合物大规模范围内进行功能性分析，多伦多大学的研究者研发了affinity-tagged ORF文库，旨在促进蛋白质-蛋白质相互作用的研究。

为了创建这个库，研发团队挑选出代表广泛生物覆盖度的ORF，使用噬菌体重组系统，将编码亲和纯化标签的序列特异性PCR产物插入至不连续的E. coli染色体中。共成功标记了857个蛋白，包括198个必需蛋白和保守蛋白。超过四分之一的蛋白质已被源实验室成功纯化。

文库亮点：

（1）生成功能多样性的蛋白质复合物可靠结构网络；
（2）深入探索无特征蛋白的功能；
（3）概述细菌相互作用的拓扑结构。

规格	货号
E. coli SPA-Tagged Collection（文库）	OEC4627
E. coli SPA-Tagged Strain（单克隆）	OEC4626
E. coli TAP-Tagged Collection（文库）	OEC4630
E. coli TAP-Tagged Strain（单克隆）	OEC4629