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PCR array芯片全新升级

时间:2021-09-23 11:37:46 浏览次数:6484

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Pcr array芯片采用的一种高通量的方法利用实时定量PCR聚焦信号转导、生物过程或疾病研究通路中的一组基因,无论您感兴趣的是生物标志物的发现、芯片后续研发、药物开发、疾病鉴定PCR array都能实现您感兴趣的基因的表达分析研究,涵盖人、小鼠、大鼠、狗、恒河猴、猪、鸡、牛、马、兔、CHO细胞、果蝇、斑马鱼等13个物种的200多条信号通路中覆盖的几乎任何基因(96和384孔板可供选择)。

新升级QuantiNova LNA PCR system芯片系统不仅继承了RT2 Profiler PCR Arrays芯片的所有优点,还提升了芯片的兼容性使其功能更加强大而便利。

新升级QuantiNova LNA PCR system芯片系统特点如下:

  • 与RT2芯片一样,提供人、大鼠、小鼠多达200多条的信号通路mRNA芯片,同时还有lncRNA芯片以及miRNA芯片
  • Ø 所有的引物升级成LNA修饰,特异性稳定性更强
  • Ø 该芯片兼容了两步法和一步法检测,并且有SYBR Green染料法以及探针法可选
  • Ø 该芯片有预制板,半定制板,定制板三种类型,提供1-84个基因96(孔板)和84-370个基因(384孔)定制
  • Ø 对于通路中的单个基因可以选择不同的转录本(通过引物设计)
  • Ø 定量兼容208054试剂,40个循环理论时间12分钟,加上仪器自动变温过程半个小时内即可完成实验,并且含有黄色惰性染料,加样过程颜色变化不会出错。


PCR array芯片整个实验流程

芯片整个实验的流程跟普通的荧光定量实验没有任何区别,有一台荧光定量PCR仪就可以开展实验,从最开始的样本的制备-RNA的提取,逆转录成CDNA,配置定量的体系上机,到最后的数据分析。数据分析QIAGEN提供免费的网页版数据分析软件,只需按照表格填写数据上传即可得到相应的报告和各种实验结果图。


兼容两步法和一步法

一步或两步超快速程序。QuantiNova LNA PCR系统提供一步或两步RT-PCR选择,超快且便捷的程序只需2小时即可完成。


单个基因的不同转录本

RT2系统芯片针对的基因是所有的转录本,在新升级QuantiNova LNA PCR system芯片系统中,单个基因可选择不同的转录本。


检测的灵敏度高

QuantiNova LNA PCR检测可在宽动态范围内对靶标进行准确,灵敏和线性定量。制备10 ng至100 pg输入cDNA的十倍稀释液,并使用QuantiNova LNA PCR Assay对Bio -Rad CFX96或Bio-Rad CFX384仪器上的7种不同mRNA靶标进行定量。该测定在每个稀释点均显示出准确的结果,表明了在整个稀释范围内的测定效率,如所示的示例扩增曲线(IFI16,10 ng至1 pg)所证明。


高线性范围

QuantiNova LNA PCR检测可实现mRNA的高表达和低表达检测。使用可商购的DNA模板(gBlock)评估QuantiNova LNA PCR检测的PCR性能。将ATP6V0D2,BRCA2,CCND1,CDK6和PPA1的DNA模板从1x109连续稀释至10个副本,并使用Bio-Rad CFX96或Bio-Rad CFX384仪器用QuantiNova LNA PCR分析法进行定量。QuantiNova LNA PCR测定法显示出高线性范围,并具有出色的灵敏度和接近最佳的效率。整个输入范围内的高线性度对于防止相对表达式计算中的偏差至关重要。


极佳的稳定性

QuantiNova LNA PCR分析试剂盒在所有热循环仪仪器上均可提供稳定的性能。制备10 ng至1 pg的十倍输入cDNA稀释液,然后用QuantiNova LNA PCR分析试剂盒在10个不同的PCR循环仪上对CCND1和SEPRINA1基因进行定量(快速如果可能的话,请进行循环):Thermo Fisher QuantStudio,Thermo Fisher ViiA 7,ABI 7500 Standard,ABI 7500 FAST,ABI StepOne,Bio-Rad CFX96,Bio-Rad CFX-384,QIAGEN Rotor-Gene Q,Roche LightCycler 480和Stratagene / 安捷伦Mx3000p 结果显示,尽管循环条件,反应体积和仪器形式有所不同,但所有测试的循环仪均具有一致且可重复的测定灵敏度,并且测定效率很高。显示的是来自3个经过测试的循环仪CCND1的示例扩增曲线。


板和板之间的一致性和重复性

板和板之间的一致性和可重复性。QuantiNovaLNA Probe PCR Focus Panels提供一致且可重复的基因表达分析。使用QuantiNova LNA Probe PCR Human Cell Cycle Focus Panel分析了用PMA处理的MCF7细胞的两个重复平板。


基因变化的可靠定量结果

基因表达变化的可靠定量.QuantiNova LNA PCR Focus Panels提供可靠的基因表达分析结果,与公开的生物学发现一致。使用QuantiNova LNA PCR人发炎细胞因子和受体小组分析了用TNF-α处理的HeLa细胞。


mRNA芯片部分通路列表

以上是部分通路的列表,关于mRNA芯片有多达200多条信号通路可提供。

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