分子疑难解答

Horizon标准品

时间:2021-11-10 13:40:08 浏览次数:3904

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Horizon Discovery是全球领先的细胞来源高品质分子标准品供应商,为临床研究提供精确突变频率的gDNA, FFPE DNA, FFPE RNA, cfDNA, fcDNA形式的标准品。提供最高级别标准的标准品基于horizon拥有最高级别的资质认证、QC/QA体系,资深的专家设计研发以及丰富基因编辑经验积累。无论是方法开发,验证诊断方法优化,horizon都可以给您全方位支持,提供最佳的质控参考品,同时也可根据您的需求做客户定制的相关产品。

1、gDNA标准品:将不同突变的细胞系按照一定的比例混合,提取基因组DNA生成gDNA标准品 

产品特点:
    可用于建立任何检测方法的检测限度  
    涵盖的等位基因频率范围:0.1 - 100%  
    具有精确的拷贝数和等位基因频率,经ddPCR验证
    可用于评估NGS检测体细胞突变、遗传突变的性能
    可用于评估Sanger,qPCR测序实验检测体细胞突变的性能

热卖gDNA标准品:
HD829:Myeloid DNA Reference Standard
    经ISO 13485认证,涵盖与髓系癌症相关的19个基因、22个突变
    一次实验对照即可实现多位点测序信息验证
    6个插入/删除 (INDELs),帮助优化测序结构变异的实验性能
    针对FLT3,设计了一个新的300bp长片段插入——ITD300 变体,代表真实患者体内的大片段插入变异
    15个位点突变频率为5%,可用于临床相关的体细胞突变检测限确定 
    7个位点突变频率在10-70%,可用于高频率遗传突变的验证

HD827:OncoSpan gDNA (泛肿瘤参考标准品) 
    样本来源:人类细胞,最大程度接近患者样本
    覆盖多种癌症:肺癌、结直肠癌、乳腺癌、血液病等
    涵盖位点多:152个关键癌症基因,386个突变位点
    突变位点信息明确:可直接网站下载,契合大Panel概念和外显子组测序平台
    变异位点多为已知数据库位点:249个具有COSMIC ID的变体,30个插入/删除 (INDELs)
    突变频率范围广:1-100%,52个位点突变频率 ≤ 20% ,可用于实验检测限的确定
    多平台验证:ddPCR(25个突变位点),500X全外显子测序()
    下单即可获得对应批次产品raw NGS数据秘钥(bam, bed and vcf files)

HD734Tru-Q 7 (1.3% Tier) Reference Standard  
    适用于任何NGS文库的制备,包括全基因组、全外显子组、自定义捕获、爬向扩增子Panel等
    Quality-Seq (Q-seq) NGS 参考标准范围,支持NGS测序平台的开发和持续验证
    涵盖多个内源性SNP、插入和缺失
    Tru-Q 系列标准品可使用Tru-Q 0野生型标准品稀释更低的等位基因频率
    Tru-Q系列在5%等位基因频率范围内有4个不同的标准,可以作为“盲样”进行实验验证

 
gDNA目录产品信息

2、FFPE标准品将不同细胞系混合物包埋进蜡块中,然后将蜡块切成15um的蜡片 

产品特点:
分析前步骤中的可变性控制
支持任何测序工作流程中的分析前步骤:
•    DNA提取
•    DNA量化
模拟临床患者样本:
•    细胞系来源
•    突变频率范围

热卖FFPE标准品
HD784: ALK RET ROS RNA fusion  
    适用于评估NGS, RT-PCR, RT-qPCR检测基因融合的性能
    来自单细胞稀释的克隆细胞群和受控的制造环境,确保EML4-ALK1、CCDC6-RET和SLC34A2-ROS1的可重复扩增水平,从而实现一致的外部质量控制
    评估工作流程的完整性,从分析前的RNA提取到融合检测  
    优化和验证新的靶向RNA panel,并常规监测检测的性能  
    确定平台、实验室、操作人员和分析之间的分析变异性和可重复性

 
FFPE目录产品信息

3、cfDNA标准品:将gDNA通过超声,分割成平均长度为160bp左右的片段,生成cfDNA标准品 

产品特点:
    模拟临床样本中的循环肿瘤DNA
    缓冲液类型:人工模拟血浆、Tris-EDTA (10mM Tris-HCl, 1mM EDTA), pH 8.0
    打断方式:超声(Covaris sonicator E220系统)打断,平均片段长度为160-170bp
    突变频率:最低可至0.1%
    适用于所有液体活检工作流程:文库制备、变异检测、信息分析
    适用于各种检测方法:NGS、PCR检测等

cfDNA目录产品信息:

货号 产品名称 类型 包装规格
HD833 OncoSpan Multigenes 350ng, 20ng/ul
HD780 Multiplex I cfDNA Reference Standard Set Multigenes 350ng, 20ng/ul
HD816 Multiplex I cfDNA Reference Standard Set in Synthetic Plasma Multigenes  800ng, 400ng/ml
HD817 Multiplex I cfDNA Reference Standard Set in Synthetic Matrix Multigenes 400ng, 400ng/ml
HD786 Structural Multiplex cfDNA Reference Standard Multigenes  350ng, 40ng/ul
HD825 EGFR Multiplex cfDNA Reference Standard Set EGFR 350ng, 20ng/ul

4、fcDNA 

产品特点:
    定量多重参考标准(QMRS)组合包括多个内生snp、插入和缺失。
    涵盖11个突变,突变频率为0.8-24.5% 
    适用于评估和优化DNA提取操作,不会浪费宝贵的临床患者样本
    确保NGS工作流程的稳定性,保证建库、信息学分析能够容纳高度降解的样品
    评估福尔马林对检测的影响
    优化和验证新的癌症panel,并定期监测检测结果

fcDNA目录产品信息:

货号 产品名称 类型 规格
HD798 Quantitative Multiplex Reference Standard fcDNA (mild)  Multigenes 1µg, 50ng/µl
HD799 Quantitative Multiplex Reference Standard fcDNA (moderate) Multigenes 1µg, 50ng/µl
HD803 Quantitative Multiplex Reference Standard fcDNA (severe) Multigenes 1µg, 50ng/µl

5、定制标准品:
如果目录产品不能满足您的需求,horizon项目开发团队可以根据您的需求定制专属于您的标准品。

选择您的突变形式

l  可从250多个现成的临床相关变体中选择,或定义您自己所需的变体集

l  所有的突变都来自正常或癌症细胞系,包括:CNVs, INDELs, Structural variants, Fusions

确定您的突变频率(突变频率可低至0.1%)

horizon细胞系衍生标准品提供精确的突变频率验证:

l  低突变频率支持液体活检分析

l  同一产品中有不同的突变频率,用于最优的工作流程控制

选择您需要的产品形式

不同产品形式满足您的需求:

l  Cell-free DNA (cfDNA)

l  Formalin-compromised DNA (fcDNA)

l  FFPE

l  Genomic DNA (gDNA)

l  Naked RNA

成功交付

l  目前已经成功设计,投入使用超过1000个定制参考标准品

l  为技术领先的诊断公司和平台开发者提供支持

l  按照ISO 13485:2016或9001:2015生产,支持GMP生产

上海优宁维生物科技股份有限公司

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