BD Rhapsody: 单细胞分析工作流程
1. BD Rhapsody 核心技术之微孔板
一个微孔 = 一个单细胞 + 一个磁珠
BD Rhapsody Express单细胞分析系统提供的单细胞分割,以微孔为基础,功能强大。
● 最低限度一套台式设备,没有射流泵
● 当细胞在重力作用下沉入微孔时,可以对其进行温和的处理
● 每个BD Rhapsody微孔板均包括一个超过22万个分区的微孔阵列
● BD Rhapsody"微孔板体积约为600μL,稀释细胞悬浮液可直接装入微孔板,无需将其浓缩到非常小的体积
● 由于没有微流通道,因此不需要担心通道堵塞的问题
● 微孔经过特殊处理,以防止细胞粘附在表面,并进行深入的质量控制
Rhapsody利用微孔进行单细胞分离,属于Microwell-seq。 20万个微孔的尺寸被设计成一个微孔恰好可以容纳一个bead+一个细胞。
2. BD Rhapsody核心技术之Barcoded Bead
3. 单细胞文库制备及测序
Single cell isolation and capture流程图
4. BD Rhapsody技术优势
成本更低—— 靶向基因检测,避免看家基因占用的大量测序数据,大大节省了测序和分析成本。
超高细胞捕获效率—— 有效细胞捕获率60%,远高于市场上目前所有大通量单细胞转录组测序技术。
罕见转录本,更高检出率—— 靶向定制panel,选定特定基因组合,提高UMI计数效率,罕见转录本检测阈值更低。
克服PCR,扩增偏差——引入单细胞测序金标准,BD分子标签,降低非特异性表达。
实理更高的分辨率——可以分辨更精细、微观的细胞群和细胞亚种群。
反转录的磁珠,超常稳存储——完整cDNA可在磁珠微球结构保存长3月(4度),随用随取。
灵活分样组合——提高样品通量(最多可12个样本同时建库,可等分,可随机组合);又可以同时进行单细胞蛋白和转录组联合检测,大大降低成本的同时,也为单细胞多组学研究提供了更高效的平台。
5. BD Rhapsody产品线overview