单细胞测序

BD Rhapsody 单细胞分析系统

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基于BD Rhapsody平台,实现高通量单细胞分选和单细胞mRNA建库,主要原理依据微孔法,实现高通量的单个细胞及无偏差3’端- mRNA捕获、扩增和检测,完成高效的mRNA反转录和扩增后进行高通量测序,结合高通量测序平台,实现单细胞基因表达研究,细胞类型解析,及细胞异质化研究等。
 
一 技术原理

基于BD Rhapsody平台的高通量单细胞RNA-Seq是结合微孔板技术,利用自然沉降的原理分离单细胞,将带有CL(Cell Label)、UMI(Unique Molecular Index,分子标签)、Poly-dT的磁珠与单细胞混合,从而实现大规模的单细胞mRNA捕获,以用于后续的文库构建。
 
二 实验流程

首先,将单细胞悬液加入BD Rhapsody™ cartridge(微孔板)中,通过随机分布和重力沉淀实现单细胞捕获;接下来,加入过量的磁珠加入到cartridge(微孔板)中,尽量使每个微孔中都有一个磁珠,以保证每个细胞都与一个磁珠配对;随后,随着细胞在微孔中裂解,mRNA分子被磁珠上的Oligo(寡核苷酸片段)捕获后,磁珠从微孔板中被收集到一个单独的试管中,用于随后的cDNA合成、文库构建。
 
两种产品模式实验流程如下:
 

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