大肠杆菌基因敲除文库限时促销
时间:2022-09-16 15:57:29 浏览次数:122
转眼又到开学季,小刀准备了一款文库产品为大家的科研助助力——大肠杆菌基因敲除文库。
众所周知,大肠杆菌具有取材广泛,分裂增殖能力强、发育周期短及结构简单等特点,已作为一种重要的模式生物在分子遗传学、生物工程领域发挥重要的作用。
大肠杆菌基因敲除文库(OEC4988)简介:
1)由日本科研机构(Advanced Biosciences, Keio University (Japan), Nara Institute of Science and Technology (Japan))和普度大学合作研发
2)涵盖3985个基因,每个基因提供2个独立的缺失菌株,共计7970个克隆
3)靶向基因均被卡那霉素抗性盒取代,盒侧翼带有可被FLP重组酶识别并切除的FRT位点
4)菌株背景:E. coli K-12 BW25113
文库具体信息:
1. 背景菌株E. coli K-12 BW25113来源
doi:10.1038/msb4100050
2. 文库内基因覆盖度
1)研发时共靶向4288个基因
2)303个未成功缺失:均为必需基因,包括37个未知功能基因
3)3985个成功缺失:3912个基因在MG1655和W3110均有注释,73个基因在之前的研究中有注释
4)3912 K-12 ORF缺失:2157个明确基因,1755个未知功能基因
doi:10.1038/msb4100050
3. 文库整体研发流程——基于λ-Red同源重组系统
1)基因敲除引物设计:全长~70nt,20nt部分靶向pKD13卡那霉素抗性框,50nt部分靶向基因序列
2)Red重组酶辅助质粒:pKD46,在L-阿拉伯糖作用下,表达γ、β和Exo蛋白,促进同源重组发生
3)卡那霉素抗性筛选重组菌
4)PCR验证:设计卡那霉素抗性序列引物和位点特异性引物分别进行验证
4. 文献应用解析
作者使用OEC4988进行全基因组筛选,发现9个基因敲除大肠杆菌株能够激活线虫的天然免疫。在这9个基因中,blc基因在许多临床病原体中展示了独特的SNP,炎症性肠病中大多数大肠杆菌为blc a251,而blc g251显著减少,从而促进肠道炎症的发生和发展。
作者挑选文库中230个和电子传递链、ATP合酶、转运体相关的基因缺失株进行筛选,最终得到7个氧化还原酶相关的基因缺失株在经TDZ处理后,细胞膜的通透性会大大降低。后续他们又在E. coli MG1655中分别缺失这7个基因进行验证,结果证明吩噻嗪类药物确实是会抑制细胞能量代谢,影响细胞膜完整性。
限时促销:
货号 | 品名 | 规格 |
OEC4988 | E. coli Keio Knockout | 1套 |
OEC5042 | E. coli Keio Knockout Parent Strain BW25113 | 1株 |
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