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【罗工流式秘籍59】Flowjo图像展示方式的合理选择与适用情况(上)

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Flowjo自带的流式图像展示方式有很多种,在结果良好的情况下,用哪种图片展示其实都是可以的,没有显著区别。

 


 

本期开始我们针对每种图形类型的优缺点和适用角度逐一进行解说:

 


 

①散点图(Dot Plot)

可以简单的理解为细胞多的地方,点就密集一些,细胞少的地方,看着就松散一些

散点图设置这里有一个空格,可以手动调整当前散点图中显示的细胞数量

 

当我们同一批次实验样本,收取的数据Events数差异过大,图像展示出来时一个样本数据显著稀少,那这个时候我们就可以考虑把它改成这种散点图去规避掉质疑

 

除此之外,散点图也可以选不同的背景及细胞群的展示颜色,能起到一定的美观效果(请忽略小编的配色审美)

 

②密度图(Density Plot)

他是表现与数据值对应的边界或域对象的一种理论图形表示方法,以整个细胞的分布密度,形成这种雾蒙蒙的图。

他的优点就是可以比较好的看到细胞的分群情况。

且在密度图上面我们也有些选项,来对密度图进行一定的修饰。

选择smooth可以让密度图进行一个边缘光滑性的处理,将杂细胞排除。

也可以选择show outliers让周边细胞以散点的形式展示出来。

也可以像散点图一样进行颜色的修饰。

 


但密度图有很多升级的用法,一般直接使用密度图展示结果的文献并不是很多.

 

未完待续... ...


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