类器官crispr-cas9基因编辑及慢病毒转染实验方法
时间:2023-09-03 19:46:29 浏览次数:2238
近几年,类器官研究十分火热,在信号通路机制,药筛药敏等研究中对类器官模型需求激增,其中利用 crispr-cas9基因编辑技术对类器官进行敲低或敲减来造模是个不错的实验方法,今天小爱带大家来了解 crispr-cas9基因编辑技术及慢病毒转染方法。
crispr基因编辑技术中有三个最为重要的组成部分:crRNA、sgRNA和Cas9蛋白。crRNA与Cas9蛋白形成复合物,sgRNA指引(crRNA/cas9)复合物靶向目的DNA区域定向切割DNA,从而达到基因编辑的目的。
图1. crispr-cas9基因编辑技术示意图
crispr-cas9基因编辑技术大体上有三种技术路线:All in one质粒转染法,病毒转化法,RNP复合物导入法。病毒转化法是将sgRNA、crRNA和表达cas9蛋白的序列整合进病毒中,再使用病毒感染细胞。相较于质粒转染法,优点在于sgRNA、crRNA和表达cas9蛋白可以持续存在于细胞中,从而达到一个很高的基因编辑效果。
图2. 慢病毒转染细胞示意图
很多小伙伴对类器官转染方法十分好奇,类器官慢病毒转染和细胞转染大同小异,主要有以下几个问题需要注意:
1.类器官在进行慢病毒转染时需不需要从基质胶里解离出来?
考虑到病毒对于基质胶的穿透性及转染效率,转染时建议将类器官从基质胶中解离出来,用适当培养基重悬在孔板内进行。
2.类器官在进行慢病毒转染时需不需要消化成单个细胞?
类器官在进行慢病毒转染时,消化成单个细胞来转染效率比较高,建议消化成单个细胞进行感染。
3.类器官转染慢病毒多长时间合适?
转染时间可根据实际实验情况调整,通常是转染12-36小时,可以借鉴细胞转染时间。
4.类器官筛选时要不要消化成单个细胞?如果不需要消化,从胶里解离出来就行?还是在基质胶里就行?
类器官筛选不需要消化成单个细胞,在基质胶里就可以筛选,大部分的药物都可以穿透基质胶,作用到类器官上。
以下给大家整理了类器官转染步骤:
1.收集类器官并消化成单个细胞后,按2×105/孔铺到24孔板中(细胞密度可以自行摸索)。
2.用含有6μg/ml polybrene(polybrene的浓度可以自行摸索)的1ml新鲜类器官培养基替换原培养基,加入适量病毒悬液,37℃孵育。
3.(对polybrene毒性敏感的细胞选作此步骤)4小时后加入1ml新鲜培养基以稀释polybrene。
4.继续培养12-36小时后,如有少量细胞贴壁,可用枪头轻柔吹打下来,混匀,将细胞培养基混悬液收集至离心管中(一般是6-8孔为一组)。300g 4℃ 富集离心5min后移去上清,添加1ml左右类器官传代培养缓冲液(abs9730)转移到1.5ml EP管,重新重悬离心。
5.观察收集到的组织体积,添加25倍组织体积的基质胶(abs9495)重悬混匀(金属冰盒或冰上操作)。
6.以24孔细胞培养板为例,每孔点胶25ul组织基质胶混合物进行铺板((金属冰盒或冰上操作),将铺好的培养板放入37℃培养箱中10-15min成胶,添加500-750μl 类器官培养基(恢复室温)进行培养。
7.待类器官出现明显增殖现象(一般需要2-3天),更换含有药物的类器官培养基进行筛选(如嘌呤霉素等),没有转染成功的类器官将会裂解凋亡,从而筛出成功转染的类器官。
(图源网络,仅供学习参考用)
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