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BD Rhapsody单细胞助力癌症发生发展及转移分子机制

时间:2021-11-22 13:48:10
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发表杂志:Nature Cell Biology 样本选择:27个不同类型的前列腺肿瘤样本
发表时间:2021年1月 样本类型:13个前列腺癌患者样本

研究结果:

1.    上皮细胞中发现与预后相关的细胞亚群

所有上皮细胞进一步分为16个细胞亚群,其中Cluster 10 和cluster12 分别被鉴定为Basal/Intermediate 和CellCycle亚群。通过临床数据分析,发现Basal/Intermediate跟较好的预后相关。

2.   肿瘤浸润免疫细胞分析

通过对免疫细胞亚群的分析,发现在两个效应T细胞(cluster3,5)和1个调节T细胞(cluster6)亚群中高表达KLK3基因,而KLK3基因是前列腺癌的特征基因。基因共表达网络分析的结果提示,T细胞中KLK3基因高表达可能跟囊泡运输有关,进一步采用流式分选、RNA 荧光原位杂交、免疫组化等验证实验也提供了相关的实验证据。

3.     内皮细胞中鉴定出跟前列腺癌发展相关的细胞亚群

重新将3115个内皮细胞分为六个亚群,其中部分亚群表现肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)的分子特征,被鉴定为激活的内皮细胞(aECs)。不同程度的前列腺癌单细胞数据拟时间分析结果表明,激活的内皮细胞亚群随肿瘤发展比例增加。并且,流式分选的结果也能证实激活的内皮细胞主要来自去势抵抗性前列腺癌样本(CRPC)。