QIAGEN 奥密克戎不可怕！！！——奥密克戎衰减复制和病理研究文献分享

自从2019年新冠病毒问世以来已经过去了两年，但是如今全球仍被新冠病的阴影深深笼罩。2021年11月，我们的大毒王Omicron奥密克戎在非洲横空出世，随即便以其高传播速度，高隐匿性 疯狂扩张，如今他的魔爪已经遍布全球，例如新年过后的苏州疫情。

正如勇士讨伐魔，我们也有很多科学家对Omicron奥密克戎进行深入研究，去了解他，攻克它。今天小编鲁大师就给大家分享一下来自香港大学著名微生物学、传染病学专家袁国勇教授课题组及其合作者对Omicron奥密克戎在复制和致病性衰减相关机理的研究，研究成果以“加速预览”发表在Nature期刊上。

衰减复制体外研究

发现：复制减弱更强
科学家们发现了相比较于SARS-CoV-2原始株以及其其他变异株，Omicron奥密克戎表现出更强的复制衰减。通过测量48小时的复制中间体亚基因组薄膜（sgE），在Calu3人肺上皮细胞中，Omicron奥密克戎的复制严重减弱，且在后续的感染性病毒颗粒实验中，Omicron奥密克戎也表现出较低的水平。
 

图 1 Omicron 奥密克戎和其他病毒株复制衰减比较

衰减复制的机制研究
为了进一步去验证Omicron奥密克戎衰减复制的机理，研究人员做了病毒感染细胞的实验，实验发现和于SARS-CoV-2原始株以及其变异株相比，Omicron奥密克戎在Calu3和Caco2细胞系中衰减的特别明显，但是在Vero细胞系中，却不是很明显。研究人员联想到病毒进入细胞质膜是通过TMPRSS2调节的。但是Vero细胞系TMPRSS2缺乏，因此进入这类细胞是由其他物质调节。于是科学家们提出一个大胆的假设，Omicron奥密克戎降低了TMPRSS2的是使用能力，才导致了其在Calu3和Caco2细胞中明显的复制衰减。为了验证这一假设，科学们安排了一波各病毒株和TMPRSS2表达的实验。
 

图 2Omicron奥密克戎使用TMPRSS2效率非常低

结果证明，在TMPRSS2过表达的细胞系中，相比较于其他病毒株，Omicron奥密克戎的伪病毒进入表现的很低，可以表明对于TMPRSS2使用能力非常低。

衰减复制和病理学的体内研究

我们科学家们绝对不会满足体外研究，毕竟这病毒可是实打实的感染在人身上，于是研究的第二趴就是在小老鼠身上做的体内实验。K18-hACE2转基因小鼠被感染了病毒，然后收集了它们的组织进行病毒评估。结果发现相比于SARS-CoV-2其他病毒株，Omicron奥密克戎表现出低复制量，证据就是RdRP基因拷贝量低（这个基因调节RNA病毒基因组的复制和转录）。
 

图 3 不同病毒株RdPr在小鼠鼻甲和肺器官中的表达

科学家在这个研究中还发现Omicron奥密克戎并不会对感染病毒的小鼠造成很验证的体重减轻，但是对比于其他兄弟病毒株小鼠的存活率却显著提高了。
 

图 4 小鼠存活率 

总结

Omicron奥密克戎对TMPRSS2的使用能力低导致了其复制衰减能力强，同时也造成了它致病率低，在感染表现上并不会造成严重的体重减轻，提高了动物的生存能力。鲁大师想这或许就能解释为什么现实中很多Omicron奥密克戎患者都是无症状感染者或者轻症患者。病毒虽然还在蔓延，但是只要多注意防范，我们就不会和它邂逅。就算不幸中招，咱们也不要怕，及时检测和就医，现在的病毒也许并不会带来那么多生离死别和悲伤的故事，这个研究结果无疑对我们战胜病毒亦或是和病毒可以和谐相处带来了更多的希望。

正所谓工欲善其事必先利其器，好使的科学仪器和试剂会让研究事半功倍，德国QIAGEN凯杰作为样本处理大专家助力了这场科研，科研人员们用到了好几款德国QIAGEN的产品，就让鲁大师给您介绍介绍

试剂安利PART
Omicron奥密克戎是RNA病毒，在实验中科学家也使用了QIAGEN的病毒RNA提取试剂盒QIAsymphony RNA kit（货号：931636）来提取被感染细胞中的病毒，用RNeasy Mini kit（货号74106）来提取动物实验中器官里的病毒。提取出来的病毒核酸由QuantiNova Probe RT-PCR kit（货号208354）定量分析。

名称	货号	用途	样本类型	特点
QIAsymphony RNA kit	931636	RNA 提取	动物细胞，组织，FEEP石蜡切片	可搭配QIAsymphony 仪器，低上样量（低至10 cells）高提取率
RNeasy Mini kit	74106	总RNA 提取	细胞，组织和酵母	快速便利，总RNA提取金标准
QuantiNova Probe RT-PCR kit	208354	荧光定量		探针法，一步法

凯杰作为核酸提取顶流品牌，除了上述这些受到科学家青睐的产品外，还有很多好用的RNA提取试剂盒哦，这里鲁大师再简单提几个，说不定此刻看文的你，今后就用的到哦

名称	货号	样本类型	特点
QIAamp RNA Blood mini kit	52304	新鲜血液和动物组织	先裂解红血球，消除血红蛋白的干扰，再裂解白细胞，得到高纯度RNA
RNeasy Plus Mini Kit	74134	动物组织，细胞，细菌和酵母	含gDNA去除柱，去除基因组DNA污染
miRNeasy Mini Kit	217004	细胞和组织	miRNA提取

 
仪器安利PART
凯杰QIAGEN的Tissue Lyzer II，这是一款专业的样本破碎机，长这样。 

特别适合高通量的样本破碎，适用于人类、动物和植物组织、细菌和酵母。可纯化获得高品质的DNA、RNA、miRNA和蛋白质，甚至对于难裂解的组织也具有高度的可重复性。总之就是好使。在这场实验中，科学家用它来破碎从注射了病毒的老鼠身上取下的器官。凯杰QIAGAN旗下还有以下这几款高通量自动化仪器，可以满足您不同实验需求。

仪器	目的	通量
QIAsymphony SP核酸提取纯化分析仪	纯化DNA、RNA和蛋白质	每批1–96个样本
BioRobot Universal System	纯化DNA和RNA	96孔板
QIAxcel	对DNA片段和RNA进行电泳分析	每批多达96个样本
QIAgility	反应体系构建	每批多达384个样本
Rotor-Gene Q实时荧光定量PCR分析仪	real-time PCR和HRM分析	每批多达100个样本
PyroMark Q96 MD or ID	甲基化和突变分析	每批多达96个样本