【罗工流式秘籍59】Flowjo图像展示方式的合理选择与适用情况(上)
时间:2023-02-07 11:13:22 浏览次数:517
Flowjo自带的流式图像展示方式有很多种,在结果良好的情况下,用哪种图片展示其实都是可以的,没有显著区别。
本期开始我们针对每种图形类型的优缺点和适用角度逐一进行解说:
①散点图(Dot Plot)
可以简单的理解为细胞多的地方,点就密集一些,细胞少的地方,看着就松散一些
散点图设置这里有一个空格,可以手动调整当前散点图中显示的细胞数量
当我们同一批次实验样本,收取的数据Events数差异过大,图像展示出来时一个样本数据显著稀少,那这个时候我们就可以考虑把它改成这种散点图去规避掉质疑
除此之外,散点图也可以选不同的背景及细胞群的展示颜色,能起到一定的美观效果(请忽略小编的配色审美)
②密度图(Density Plot)
他是表现与数据值对应的边界或域对象的一种理论图形表示方法,以整个细胞的分布密度,形成这种雾蒙蒙的图。
他的优点就是可以比较好的看到细胞的分群情况。
且在密度图上面我们也有些选项,来对密度图进行一定的修饰。
选择smooth可以让密度图进行一个边缘光滑性的处理,将杂细胞排除。
也可以选择show outliers让周边细胞以散点的形式展示出来。
也可以像散点图一样进行颜色的修饰。
但密度图有很多升级的用法,一般直接使用密度图展示结果的文献并不是很多.
未完待续... ...
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