流式的上机操作总是难倒一片初学流式的英雄好汉。很多刚接触流式的老师都困在了这个仪器不会操作上,尤其是仪器平台也没有老师帮忙的,一切还得全靠自己,按照仪器操作指南我能顺利开机关机,新建文件,但是一上样本就难住了。到底哪些参数是需要调节的呢?这里小编就为大家简单做个总结和介绍。
对于基础的分析实验,上机最主要调节的就是仪器的电压(或增益)值,还有就是去杂质的阈值。补偿值也可以在仪器上稍作调节,可以初步看一下数据的分群结果,当然这个参数值也可以记录完所有数据后再导出放到Flowjo软件上去调节,也是可以的。所以本文主要介绍电压参数和阈值。
一、电压(增益)参数:
电压即光电倍增管(PMT,光子计数器件)的工作电压。电压越高,单个光子转换成电子的数量越多,反之亦然。对于大多数仪器来说,电压参数是必须在上机预览样本的时候才能调节的,一旦采集记录数据,电压就无法再更改的,除非重新上样调节。需要调电压的通道包括FSC和SSC散射光电压调节,确保检测的目标群在显示范围中心;其次是使用到的各个荧光通道,确保阴阳分群效果的同时,阳性群又不会跑出最大显示范围(所以调电压并非严格只用空白对照,可以用单染辅助调节)。
FSC/SSC电压参数调节合适能顺利找到目标细胞群体。
荧光通道电压参数调节合适能,更好的提高待测marker分群水平。
不同的仪器调节的数值是有差异的,没有可比性。另不同的仪器调节手法也是有差异的:
如BD的流式仪器主要就是调节电压参数,电压调好了,数据采集基本就没有问题了;
Beckman的仪器需要注意电压值和补偿值的适应性,两个补偿大的荧光通道,电压相差不能太大(例如某被溢漏的通道电压增益只有19,干扰该通道的荧光通道电压增益却是高达500),否则会导致补偿值异常大,在满足分群的基本条件下,尽量减少相邻通道或有干扰的两个通道之间的电压增益值差距;
安捷伦的流式分析仪(如:NovoCyte),比较特殊,很多时候它的电压值是工程师已经调好的,我们上机时是不需要修改的,只需要修改显示范围,确保目标群都在合适的可视范围,且同一套样的各个荧光通道显示范围一致即可,导出数据的时候就可以根据图形导出,确保样本之间的可比性。
二、各个通道的信号放大输出模式:
线性放大(lin):适用于较小范围内变化的信号,或代表生物学线性过程的信号,例如:FSC、SSC、细胞周期检测等。
对数放大(log):应用于荧光染色的情况,也就是基本荧光通道都用log;特殊实验中检测对象较小时,可能FSC和SSC也会选择用log,比如做多因子检测的CBA,血小板检测等。
三、阈值(Threshold):
阈值就是排除信号的一个大小范围,合理调节阈值会有效排除多余的碎片信号,减少无用数据量。如图所示,在FSC阈值较低的情况下能看到左下有较多的碎片信号,当把FSC阈值调高以后,就少了很多这样的碎片信号。
那么我们上机的时候只要把这些最重要的参数调节合适了,我们就能达到很好的流式数据获取的目的。
BD的FACSCelesta上机操作,可观看如下视频:
(注:BD旗下的流式仪,只要是Diva系统操作界面基本一致,可作为参考)
https://www.bilibili.com/video/BV1Qb4y1v7K7/?spm_id_from=autoNext&vd_source=5c737735debfdb33bc734c4d17d12891