Q:罗工,我最近分析数据遇上了点困惑,特来求教
Q:您看我下面两个样本的结果图,完全一样的模板和圈门逻辑,上面这个样本的图片挺好看的吧,可是到了下面那个样本,位于0点的阴性群,后面多出了一个阴性群的拖尾,不知道这是什么情况:
罗工:你这个一看就是补偿没调好!
罗工:你打开下面这个样本的原始图片,纵坐标轴挨个染色通道切换着看一下,肯定是有哪个通道对当前这个PE通道的补偿值调节过度了。
Q:我调整了,截图您再帮我看下
罗工:下排中间的那个图,纵轴明显向负轴偏移。
罗工:这说明,当前纵轴的荧光,即PE-CY7通道,到横轴的PE通道的补偿调节的过度了,需要把当前补偿的数值调小,让图片回正。
Q:真的诶,我把这个数值调小了之后,图片就回复正常了,谢谢罗工。
Q:不过,罗工,你看我最开始的图,为啥没调好补偿有的样本的数据却还挺好看?
罗工:你看你的PE-CY7染得是IFN-γ,这不是每个样本中都表达很高的,你可以去回看下原始数据,错误补偿时,看不到阴性拖尾的那些,肯定都是IFN-γ表达不高,或者压根没表达的样本,所以看着不明显。
罗工:所以说,我们检查补偿的时候,多切换几个样本看下,会更容易发现问题。
Q:OO,原来如此!