一文读懂抗体选择最全指南,建议收藏!
时间:2024-04-08 16:19:12 浏览次数:6212
今天是《抗体选择最全指南》专题的第二期,上期在《抗体小知识》中介绍了抗体相关的基础知识,本期会介绍关于一抗和二抗的选择原则,以及小优精心总结的“优选技巧”,大家一起来看看吧。
一抗选择三要素
一抗选择需要注意的是三点:目的蛋白、反应种属及实验方法
一、目的蛋白
1、确认抗体检测指标与目的蛋白一致
一个蛋白往往有多个不同的名称,所以务必要确认抗体的检测指标与目的蛋白一致,最简单的办法是比对uniprot ID,两者一致就没有问题。
2、确认抗体的灵敏度
如果检测的是内源性蛋白,还需要确认一下抗体的灵敏度。大部分情况下抗体都是检测内源性的,但有少部分抗体的灵敏度是外源的(transfected only),那么检测内源性蛋白的时候就可能会做不出来,这种情况投诉厂家也不会受理,所以在购买前务必要确认清楚。
二、反应种属
1、确认抗体的反应种属(Reactivity)包含实验样本种属
这个很简单,就是看说明书上的反应种属(reactivity)有没有包含待测样本的种属,如果检测人的样本,它写了human,那就可以做。
需要注意的是,有些同学会把样本种属和抗体来源宿主搞混,我们这里讲的种属是待检测的样本种属,在抗体说明书上标注为反应种属(reactivity),抗体的来源宿主是Source或者Host。
2、什么是预测可以检测的种属?
有一些说明书上会写预测会与哪些种属反应(Predicted to work with),这个数据一般是厂家根据蛋白同源性预测得来的,但没有做过验证,也不会有质保,如果买了这个抗体做不出来,厂家也不会受理售后投诉。
3、尽可能选择与样本不同种系物种的一抗
如果检测的是小鼠样本,那么一抗尽量不要选小鼠或者大鼠来源的,也就是source/host不要是鼠的,因为要避免二抗和样本里面的内源性免疫球蛋白发生反应,造成高背景。
4、样本种属稀有,没有验证过的抗体怎么办?
有些同学做的样本比较稀有,比如猪、牛等等,可能在市面上找不到已经验证过的抗体,怎么办呢?也是有办法的。可以先去查抗体的免疫原序列,拿它跟待测的蛋白做同源性分析,如果同源性比较高,建议是超过90%,那么可以尝试,但这种情况下做不出来厂家是没有质保的。同源性分析怎么做呢?视频见下方。
另外,有些品牌,例如CST的抗体免疫原序列属于商业机密不会公开,我们可以把自己的蛋白序列提供给他们,让他们的专家来帮我们分析同源性的情况,给出使用建议。
三、实验方法
确认抗体说明书上的实验方法(application)包含待做的实验。
如果做WB的话那就比较简单,application里面写了WB就行,如果目前只做WB,也建议选择实验方法比较多的抗体,因为如果后续要补其他实验的话就可以直接用,不用再买了。
如果要做免疫组化(IHC),需要注意样本类型厂家有没有验证过,样本类型一般会分为石蜡切片、冰冻切片或者细胞,厂家会把验证过的样本类型写在说明书上或者标注在图片下面。如果不是厂家验证过的样本类型,一般不会有质保。
下图我们列出了部分品牌的IHC/ICC/IF的质保范围。
敲黑板了,R&D systems公司的IHC抗体对样本和染色方法的包容性很强,标注了IHC,表示组织石蜡切片/冰冻切片,无论是酶染还是荧光染色都可以;如果标注了ICC/IF,表示细胞样本,酶染还是荧光染色都可以。
二抗选择四要素
二抗选择有四个要素,分别是需要与一抗的特性(来源、免疫球蛋白类型)对应,并且需要根据实验方法选择标记和分子形式,接下来我们一一来看,在选择二抗之前,我们先来看看二抗的名称解读。
一、一抗的特性
1、二抗的反应种属与一抗的来源宿主相对应
在前面介绍抗体小知识的时候我们提过,抗体的Fc段是结合二抗的区域。因此二抗识别的是一抗的重链恒定区,只与一抗的种属来源有关。如果一抗的来源是兔子,那么二抗选择识别兔子的(anti-rabbit)即可。
2、二抗需与一抗的免疫球蛋白类型对应
如果一抗是多抗,比如来源于兔、山羊等,并且是 IgG 同型,那么二抗一般选择抗 IgG(H+L)(重链和轻链)的。
如果一抗是单抗,来源为小鼠 IgG1,则可以选择Anti-Mouse IgG1的,或者是anti-mouse IgG(H+L)的二抗。一般选择后者,因后者的适用范围更广。
二、实验方法
1、根据实验方法选择偶联标记
根据实验方法和显色系统不同,来选择二抗的偶联标记,下表可供大家参考。
实验类型 | 显色系统 | 偶联标记 |
WB | ECL | 酶(HRP/AP,HRP最常见) |
荧光 | 荧光标记物 | |
ELISA | 化学显色法 | 酶(HRP/AP)、生物素 |
IHC | Polymer | 酶(HRP) |
ABC法、SP法 | 生物素 | |
ICC | 荧光 | 荧光标记物 |
化学显色法 | 酶(HRP)、生物素 | |
IF | 荧光 | 荧光标记物 |
2、根据实验方法选择分子形式
(1) 大多数实验无特殊要求都可选择完整的全片段形式(二抗名称含H+L,双价)的抗体,例如以下几个:
货号 | 产品描述 | 实验方法 | 规格 |
7074 | Anti-rabbit IgG, HRP-linked Antibody | WB | 100ul/1ml/5ml |
7076 | Anti-mouse IgG, HRP-linked Antibody | WB | 100ul/1ml/5ml |
111-035-003 | Peroxidase AffiniPure™ Goat Anti-Rabbit IgG (H+L) | WB IHC Elisa | 2 ml |
115-035-003 | Peroxidase AffiniPure™ Goat Anti-Mouse IgG (H+L) | WB IHC Elisa | 2 ml |
abs20001 | HRP conjugated Goat anti-Mouse IgG (H+L) antibody | WB IHC Elisa | 100ul/500ul/1mL |
abs20002 | HRP Conjugated Goat anti-Rabbit IgG h+l antibody | WB IHC Elisa | 100ul/500ul/1mL |
(2) 如果是做间标流式、或者用IHC/ICC/IF检测Fc受体表达丰富的样本(例如淋巴结、脾脏、外周血等),建议选择F(ab')2 片段形式(双价),因为这类二抗分子量较小,比较容易穿透组织,而且能避免与活细胞上的 Fc 受体结合,产生非特异性背景;
货号 | 种属来源/对应一抗种属 | 二抗形式 | 偶联标记 | 规格 |
115-546-003 | Goat/Mouse | F(ab')₂ Fragment | Alexa Fluor® 488 | 0.75 mg |
111-546-003 | Goat/Rabbit | F(ab')₂ Fragment | Alexa Fluor® 488 | 0.75 mg |
(3) 当用两只来源相同的一抗做IF双染实验,或者一抗与所研究组织种属来源相同时,则需要选择Fab 片段形式的二抗(单价)来封闭内源性的免疫球蛋白。
货号 | 种属来源/对应一抗种属 | 二抗形式 | 偶联标记 | 规格 |
115-007-003 | 山羊/小鼠 | Fab片段 | - | 1.0 mg |
115-547-003 | 山羊/小鼠 | Fab片段 | Alexa Fluor 488 | 0.75 mg |
111-007-003 | 山羊/兔 | Fab片段 | - | 1.0 mg |
111-547-003 | 山羊/兔 | Fab片段 | Alexa Fluor 488 | 0.75 mg |
3、什么是交叉吸附(预吸附)处理的二抗?
预吸附(又称交叉吸附)是额外增加的纯化步骤,目的是提高抗体的特异性。具体方法是,利用具有潜在交叉反应性的种属制备固定血清蛋白,让含二抗的溶液通过含有这种固定血清蛋白的基质柱。非特异性二抗会留在柱中,而通过基质柱的高特异性二抗会被收集下来。也就是说,经过交叉吸附(预吸附)处理的二抗,抗体特异性更高,非特异性结合更少。
货号 | 种属来源/对应一抗种属 | 二抗形式 | 偶联标记 | 减少交叉吸附的物种(min X) | 规格 |
715-545-151 | 驴/小鼠 | Whole IgG | AF488 | Bov,Ck,Gt,GP,Sy Hms,Hrs,Hu,Rb,Rat,Shp Sr Prot | 0.5mg |
115-545-146 | 山羊/小鼠 | Whole IgG | AF488 | Hu,Bov,Hrs,Rb,Sw Sr Prot | 1mg |
111-605-144 | 山羊/兔 | Whole IgG | AF647 | Hu,Ms,Rat Sr Prot | 1mg |
这种二抗的应用主要有两种情况:
(1) 样本含有内源性免疫球蛋白时
如果待测样本含有大量的内源性免疫球蛋白,需要使用经过交叉吸附(预吸附)处理的二抗,减少二抗和内源性免疫球蛋白结合的可能。
例:样本为带有内源性免疫球蛋白的大鼠组织,而一抗为小鼠来源的,那么二抗需要选择Anti-mouse (H+L) 交叉吸附 rat的,因为大鼠和小鼠同源,二抗可能会与样本里的内源性大鼠蛋白有非特异性结合。
(2) 多色实验
在进行多色免疫组化、荧光多标或多色流式实验时,常会选择多个不同来源的一抗搭配相应二抗,同时进行检测。在这类实验中,体系内种属较多,应该使用经预吸附处理的二抗,以减少二抗发生非特异性结合的风险,降低染色背景。
例:样本为带有内源性免疫球蛋白的人源组织,做免疫荧光双染,一抗分别为mouse anti-X, rabbit anti-Y,那么二抗则需要选择Anti-mouse (H+L) 交叉吸附human、rabbit,以及Anti-rabbit (H+L) 交叉吸附 human、mouse的。
然而,在根据这些选择原则层层筛选之后,还会有不少抗体满足我们的实验需求,那么该怎么办呢?请看我们的“优选技巧”。
1、比较文献引用情况
同时有很多抗体都满足我们的实验需求的话,第一步可以看别人做的效果怎么样,如果发表过的文献多,那么这支抗体大概率是可靠的。可以直接在CiteAb网站(https://www.citeab.com/)上查询抗体的引用情况,也可以上厂家官网查看说明书。
2、比较说明书图片
第二步,我们可以参考抗体说明书上的结果图。例如下图,这两支抗体的反应种属和实验方法都类似,我们可以根据图片显示的结果情况二选一。
3、选择品牌的王牌产品线
目前市面上的很多抗体品牌,都推出了自家的王牌产品线。比如XP系列抗体就是CST应用专利技术生产的兔单抗系列产品,这个系列抗体的特异性、灵敏度、稳定性等都较普通单抗高。从说明书上看,它们的种属范围、适用实验范围会更广,而且实验效果更优,抗体稀释比例也更大,也就是性价比更高,所以一般建议优先选择王牌产品线的产品。
4、比较性价比
性价比可能是大家最关注的点之一,我们可以找到产品规格、稀释比例,计算使用总数和单次价格,最终选出单次价格最合适的那款。
例如这支抗体,规格100ul,WB的稀释比例是1:50000,原价2300。WB每张膜使用量按5ml计算,100ul*50000/5ml=1000张膜,单张膜价格为2.3元。
5、看品牌在领域的影响力
目前市面上抗体品牌非常多,很多品牌都有自己独特的优势和特色。我们在选择抗体的时候,一般尽量选择在这个领域更擅长、更有影响力的品牌。品牌在自己擅长的领域,产品线会更齐全,选择更多,而且专业资源会更多,经验也更丰富,我们能得到的支持也更多。下面我简单列举了一些品牌的擅长领域,供大家参考。
CST:信号通路金标准
BD:流式金标准
Bio-techne:Elisa及细胞因子金标准,全能抗体
MIltenyi:磁珠分选金标准,流式抗体
Jackson:二抗金标准
Absin:中国人自己的生命科学百宝箱,性价比高货期短
斯达特:诊断抗体、伴随诊断抗体
Alomone:膜蛋白专家
Santa cruz:产品齐全,性价比高
Cytoskeleton:细胞骨架抗体
Agrisera:植物抗体
Lifespan:高品质,少见指标抗体
SYSY:高品质,少见指标抗体
Atlas antibodies:高品质,少见指标抗体
Bioxcell:体内研究抗体
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注:文章内容来源于小优大学堂讲座《抗体选择最全指南》,点击此处观看讲座视频
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