你是否在选择二抗的时候遇到过以下的情况:
IHC/IF多标实验中一抗二抗种属傻傻分不清?荧光标记不知道怎么选择?
IHC实验结果不准确,遇到高背景、假阳性的情况?
一抗种属来源相同时,不知该选择什么样的二抗来进行同步法IF双标记染色?
IP/Co-IP后的WB实验出现非特异性条带?
别急,这篇超全的二抗选择攻略可以助你解决这些疑惑。
本文将从两个角度(1)二抗选择的基本步骤(2)不同的实验怎么选择二抗,来教大家如何在日常实验中选择二抗,干货满满,也可以先收藏后看哦~
Part 1 选择二抗的4个基本步骤
1.选择正确的种属来源和反应物种
二抗的选择首要基于一抗,应与一抗的种属来源相对应,且需要来自于不同的物种(如下图所示)。
图1.二抗种属反应物种应与一抗种属来源相同,且来源应与一抗种属来源不同。
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2.选择正确的二抗形式
选择合适且正确的二抗形式,也是获得实验成功的关键之一。三种二抗形式Whole IgG、F(ab’)2、Fab如下图所示。
图2. “Y”型的二抗分子可以被酶水解成两种不同的形式
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3.抗体特异性的选择
要注意区分二抗的特异性和形式的不同,特异性指的是二抗识别的不同一抗亚型或某特殊区域。抗体的特异性主要基于以下三种形式:
❖轻链特异性
❖Fc端特异性
❖亚型特异性
图3.免疫球蛋白的不同类型和亚型,以及不同亚型特异性二抗分子识别不同亚型样本示意图。
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4.偶联标记的选择
不同实验类型适合的标记类型不一样,如下表所示:
实验类型 | 适合的标记类型 |
WB/ELISA | 酶标(HRP/AP)/ 生物素标记 / 荧光标记 |
IHC | 酶标(HRP/AP)/ 生物素标记 |
IF/ICC | 生物素标记 / 荧光标记 |
Flow cytometry | 生物素标记 / 荧光标记 |
对于多标染色实验,下面有几种常用的配色参考(除细胞核染料外):
双色 | 三色 | 四色 | |
标记1 | Alexa Fluor 488 | Alexa Fluor 488 | Alexa Fluor 488 |
标记2 | Alexa Fluor 594 | Alexa Fluor 594 | Alexa Fluor 555 |
标记3 | Alexa Fluor 647 | Alexa Fluor 594 | |
标记4 | Alexa Fluor 647 |
Part 2 基于不同实验类型的二抗使用指南
1.常规WB实验选择Whole IgG全片段二抗
对于常规的WB实验,在基于正确的种属来源和反应物种原则上,我们一般选择酶标或生物素标记的没有特殊形式的全片段二抗。
常规WB部分相关二抗推荐:
货号 | 种属来源/对应一抗种属 | 二抗形式 | 偶联标记 | 规格 |
111-035-003 | 山羊/兔 | Whole IgG | HRP | 2 ml |
115-035-003 | 山羊/小鼠 | Whole IgG | HRP | 2 ml |
2.荧光WB实验选择带有荧光基团的Whole IgG二抗
与化学发光WB实验所使用的酶标记二抗不同的是,荧光WB需选择带有荧光基团的二抗(如FITC/Dylight/Alexa Fluor荧光二抗)。此外还需要搭配有合适光源和滤光片的成像仪器,如奥德赛、Bio-rad等。
图4.使用带有Alexa fluor680和Alexa fluor790基团的二抗进行荧光WB实验的示意图
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荧光WB部分相关二抗推荐:
货号 | 种属来源/对应一抗种属 | 二抗形式 | 特异性 | 偶联标记 | 可去除的交叉反应 | 规格 |
115-625-146 | 山羊/小鼠 | Whole IgG | _ | Alexa Fluor® 680 | Hu, Bov, Hrs, Rb, Sw Sr Prot | 0.5mg |
115-655-146 | 山羊/小鼠 | Whole IgG | _ | Alexa Fluor®790 | Hu, Bov, Hrs, Rb, Sw Sr Prot | 0.5mg |
3.IP后WB实验根据目标蛋白分子量,选择轻链特异性二抗或Fc片段特异性二抗
在IP或 co-IP实验中,IP实验及之后的WB实验的操作过程中通常会用到相同的一抗或同种属来源的一抗、这种情况下,如果使用常规无特异性的Whole IgG酶标二抗,WB实验中IP抗体变性后产生的重链(55kDa)和轻链(25kDa)都能够识别, 而此非特异的信号往往会部分甚至完全掩盖目的蛋白的信号。
因此,当目标蛋白位于55kDa分子量附近时,需要选择抗轻链(anti-light chain)的二抗,以避免重链的干扰(如图11);反之,当目标蛋白位于25kDa分子量附近时,需要选择抗Fc端的二抗,以避免轻链的干扰。
此外,如果有同时去除轻链或重链干扰的实验需求时,还可以选择构象特异性(conformation specific)的二抗。
图11. (A)使用构象特异性二抗的WB结果,(B)使用抗轻链二抗的WB结果,(C)使用普通酶标Whole IgG无特异性二抗
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IP后WB部分相关二抗推荐:
货号 | 种属来源/对应一抗种属 | 特异性 | 偶联标记 | 可去除的交叉反应 | 规格 |
115-035-174 | 山羊/小鼠 | 轻链 | HRP | Bov, Gt, Hrs, Hu, Rb, Rat, Shp Ig | 0.5 ml |
109-035-098 | 山羊/人 | Fc | HRP | Bov,Hrs,Ms Sr Prot | 1 ml |
5127S | 小鼠/兔 | 可同时避免轻链及重链干扰 | HRP | 100 μl | |
3678S | 小鼠/兔 | 可同时避免轻链及重链干扰 | Bov, Gt, Hrs, Hu, Rb, Rat, Shp Ig | 100 μl |
4.IHC/ICC/IF实验选择F(ab’)2形式的片段二抗
在研究某些细胞和组织时(如白细胞群体:巨噬细胞、B细胞、自然杀伤细胞等;某些组织:淋巴结,脾脏,外周血等),这些细胞或组织因表面Fc端受体过多,会与抗体分子中的Fc端相结合,从而导致非特异性结合和高背景的现象(如下图所示),俗称“假阳性”。
使用F(ab’)2形式的二抗可以避免其与活细胞中的Fc受体非特异性结合,还可避免与Protein A、ProteinG的非特异性结合,从而提高实验准确性。
图5.使用F(ab’)2片段二抗可以避免“假阳性”情况
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IHC/ICC/IF部分相关二抗推荐:
货号 | 种属来源/对应一抗种属 | 二抗形式 | 特异性 | 偶联标记 | 可去除的交叉反应 | 规格 |
109-066-006 | 山羊/人 | F(ab')₂ | F(ab')₂ | Biotin | 0.5 ml | |
109-006-098 | 山羊/人 | F(ab')₂ | Fc | Bov,Hrs,Ms Sr Prot | 1 mg | |
109-136-098 | 山羊/人 | F(ab')₂ | Fc | APC | Bov,Hrs,Ms Sr Prot | 0.5 ml |
5.多标记染色IF/IHC实验选择经预吸附处理的二抗
(1)为了防止二抗与样本,以及其他一抗种属的交叉反应,进行多标记实验的时候,首先需要选择经预吸附处理的二抗,以减少这种交叉反应;
(2)所有二抗都应尽可能的来自同一宿主物种,以此来限制二抗与来自其他物种的一抗之间的交叉反应。下图给出了一种三标实验搭配参考,因样本和三支一抗的来源分别为小鼠、山羊、兔及大鼠,应选择能够去除这几种种属交叉反应的二抗。
图6.进行三标染色实验时,实验样本为小鼠的二抗选择参考
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或直接使用二抗选择工具,让你的三标记染色实验不再难~
(3)如果一抗种属来源于不同的亚型,那么二抗则不需要来源于不同的物种,只需要选择对应的亚型特异性二抗即可,如图7所示。
图7.一抗种属来源于不同亚型的三标实验
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多标染色IF/IHC部分相关二抗推荐:
货号 | 种属来源/对应一抗种属 | 二抗形式 | 特异性 | 偶联标记 | 可去除的交叉反应 | 规格 |
711-545-152 | 驴/兔 | Whole IgG | Alexa Fluor® 488 | Bov,Ck,Gt,GP,Sy Hms,Hrs,Hu,Ms,Rat,Shp Sr Prot | 0.5 mg | |
712-585-153 | 驴/大鼠 | Whole IgG | 711-545-152 | Alexa Fluor® 594 | Bov,Ck,Gt,GP,Sy Hms,Hrs,Hu,Ms,Rb,Shp Sr Prot | 0.5 mg |
705-605-147 | 驴/山羊 | Whole IgG | Alexa Fluor® 647 | min X Ck,GP,Sy Hms,Hrs,Hu,Ms,Rb,Rat Sr Prot | 0.5 mg | |
NBP2-69595 | 山羊/小鼠 | Whole IgG | IgG2b | 10 mg | ||
NBP2-69628 | 山羊/小鼠 | Whole IgG | IgG3 | 10 mg |
6.一抗来源相同的双染IF实验选择Fab形式的片段二抗
有时因受限于实际的实验条件,在进行双染色的IF实验时,一抗来源于同物种。这时可以选用Fab片段二抗来进行实验,这是因为每个Fab片段二抗只含有一个抗原结合位点,因此在随后的孵育过程中不会与另一个分子相结合(即在进行顺序双标记时的第二个一抗)。
以下有两种使用Fab片段二抗进行双标记染色的方法可供大家参考:
(1)来自同一种属的两种一抗均未标记时
图8.使用Fab片段二抗进行一抗来源相同的双染IF实验(参考一)
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(2)来自同一种属的一种未标记一抗和一种或多种标记的一抗
图9.使用Fab片段二抗进行一抗来源相同的双染IF实验(参考二)
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不建议使用F(ab’)2片段抗体进行双重标记实验,因为其为二价分子,含有两个结合位点。在与第一个一抗结合之后,第二个结合位点可能仍未被占据,而这个未被占据的结合位点能够与第二抗体结合,导致假阳现象。
Tips:Fab片段二抗还可用于封闭内源性免疫蛋白:
当一抗与所研究组织种属来源相同时(例如,小鼠一抗用于小鼠组织),可以使用Fab片段二抗来阻断内源性免疫蛋白,以提高实验的准确性。
图10.(a)未封闭的内源性免疫蛋白会与随后加入的二抗分子结合,干扰实验(b)经过Fab封闭后, 内源性免疫蛋白不会与随后加入的二抗分子结合
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一抗来源相同的双染IF部分相关二抗推荐:
货号 | 种属来源/对应一抗种属 | 二抗形式 | 特异性 | 偶联标记 | 规格 |
115-007-003 | 山羊/小鼠 | Fab | 1.0 mg | ||
109-117-008 | 山羊/人 | Fab | Fc | R-PE | 0.5ml |
109-607-008 | 山羊/人 | Fab | Fc | Alexa Fluor® 647 | 0.5mg |
115-007-020 | 山羊/小鼠 | Fab | µ chain | 1.0 mg |