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5.1.1 一步法外泌体RNA纯化(sample to RNA)

| 5.1.2 外泌体RNA纯化

以QIAGEN 77144/77164为例
推荐:用于液体样本中外泌体RNA纯化(包含miRNA在内的总RNA),血清血浆样本的上样量为100uL-4 mL,100uL-8mLCSF,细胞培养上清的上样量为16 ml(测试最大至32mL)。如果使用的细胞培养上清样本,该柱子的承载量取决于细胞的类型和细胞的培养条件。使用细胞上清样本时,推荐使用无血清培养基或无外泌体血清体系,以免残留EV的干扰。
尿液中可能含有各种代谢物,它们可能会干扰RNA分析,例如,使用RT-PCR或RNA-Seq。为了确保分离的RNA的最佳性能,我们建议分别分离长RNA和短RNA物种(分别大于或小于约200nt)。对于短RNA的分离,使用试剂UI (77900)。为了分别分离长链和短链RNA,RNeasyMinElute清除试剂盒(74204)和额外的缓冲区RWT (1067933)。另一种选择是将分离短rna时使用的尿液量限制在2 ml,或者在分析前相应地稀释洗脱液。尽可能使用晨尿样本,通常比当天晚些时候收集的尿液集中得多。

实验步骤

  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16
  • 1

    过滤

    推荐使用预过滤的血浆或细胞培养上清液。需要通过过滤去除大于0.8 μm的颗粒,(如用 Sartorius® Minisart® NML (cat. no. 16592)过滤器)。

  • 2

    按照样本

    缓冲XBP为1:1的比例混合,轻柔颠倒混匀5次。并使混合液达到室温。 

  • 3

    加入

    样本和缓冲XBP的混合液加入到exoEasy spin column柱子中,500g离心1 min。丢弃离心得到的液体,并将柱子重新放入收集管。 

  • 4

    离心

    加入3.5mL(或10 mL)缓冲液XWP5000g离心5 min,去除柱子中剩余的液体。丢弃收集管及其中的液体。 
    注意:如转速要求不能达到5000g,可以将转速降低到3000g且不会对分离过程产生影响。 

  • 5

    转移

    将柱子转移到新的收集管中。

  • 6

    旋转

    膜上加入700µL QIAzol。在5000 x g下旋转5 min以收集裂解液,并完全转移到一个2 ml的试管中(未提供)。

  • 7

    涡旋

    将含有裂解液的试管短暂地涡旋,并在室温下孵育5 min。这一步促进了核蛋白复合物的解离。注意:如果使用外参,在这个步骤添加到裂解液中。

  • 8

    孵育

    在含有裂解液的试管中加入90µL氯仿,并盖上盖子。用力摇晃15秒。后室温孵育2-3min。

  • 9

    离心

    4°C,12000xg离心15 min。(离心后,样品分为3个相:上部无色水相;薄的白色间期;以及较低的红色有机相。水相的体积应该约为400 μl。)

  • 10

    转移并混合

    将上部水相转移到新的收集管中(未提供),加入2体积的100%乙醇(例如,对于400µL的水相,加入800µL的乙醇),并通过上下移液几次彻底混合。请勿离心。立即继续执行到下个步骤。

  • 11

    离心

    将高达700µL的样品,包括可能已经形成的任何沉淀,注入2 mL收集管(提供)中的RNeasy MinElute旋转柱。轻轻关闭盖子,在室温下以≥8000xg(≥10,000rpm)离心15 s,弃废液。重复步骤一次。

  • 12

    添加

    将700µL Buffer RWT添加到RNeasyµl Elute旋转柱。轻轻关闭盖子,在≥8000xg(≥10,000rpm)下离心15 s。

  • 13

    连接

    将吸管500µL缓冲液RPE连接到RNeasy MinElute旋转柱上。轻轻关闭盖子,以≥8000xg(≥10,000rpm)离心15 s。

  • 14

    离心

    吸管500µL缓冲液RPE到RNeasy MinElute旋转柱上。关闭盖子,以≥8000xg(≥10,000rpm)离心2 min。

  • 15

    离心

    将RNeasy MinElute旋转柱置入一个新的2 ml收集管(提供)。打开旋转柱盖,全速离心5 min,干燥膜。丢弃带式的收集管。

  • 16

    离心

    将RNeasy MinElute旋转柱置于一个新的1.5 mL收集管(已提供)中。直接加入14µl无rna酶的水到旋转柱膜的中心。轻轻关闭盖子,让柱静置1 min,然后全速离心1 min,洗脱RNA。如果需要更高的RNA浓度,可以用10µL无RNA酶水洗脱,但产率将降低约20%。

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