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5.1.2 外泌体RNA纯化

| 5.2.1  NGS-mRNA建库

下方实验步骤:以QIAGEN 217184为例

实验步骤

  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 1

    准备

    准备好纯化后的外泌体样本,不超过200uL。

  • 2

    添加

    加入5倍体积的QIAzol Lysis Reagent(见下表的配比说明)。涡旋混匀或吸打混匀。

    △点击放大图片

  • 3

    静置

    将装有裂解液的管子在室温下(15–25°C) 静置5 min。

  • 4

    混匀

    加入3.5 µL miRNeasy Serum/Plasma Spike-In Control (1.6 x 108 copies/µl working solution),充分混匀。按照说明精确配比miRNeasy Serum/Plasma Spike-In Control的储存液和工作液。

  • 5

    涡旋或振荡

    加入与起始样本等量的氯仿,盖紧盖子详。涡旋或振荡15 s。 充分混匀对随后的分相非常重要。 

  • 6

    静置

    室温(15–25°C) 下静置2-3 min。

  • 7

    离心

    4°C 下12,000 x g 离心15 min。离心后,将离心机加热至室温(15–25°C) 。离心后,样本分为3层:上清,无色水相,含有RNA;白色中间层;红色底层,有机相。 

  • 8

    吸打

    将水相转入一个新的收集管(为提供)。避免在转移时介入其他杂质。加入1.5 倍体积的无水乙醇,反复吸打几次充分混匀。不用离心。立即进行第9步。加 入乙醇后可能会有沉淀产生,但不会影响后续结果。 

  • 9

    吸取

    吸取700 µL样本,包括可能出现的沉淀,加在1 个RNeasy MinElute spin column上(柱子已经放在1 个2 ml的收集管里,收集管试剂盒提供)。轻轻盖上盖子,室温(15–25°C) 下8000 x g (10,000 rpm)离心 15 s。丢弃流出液(含有 QIAzol Lysis Reagent 或Buffer RWT,不能与漂白剂共存),留着该收集管继续第10步操作。

  • 10

    重复

    重复第9步,加入剩下的样本。丢弃流出液(含有 QIAzol Lysis Reagent 或 Buffer RWT,不能与漂白剂共存),留着收集管继续第11步。 

  • 11

    离心

    加入700 µL Buffer RWT至柱上。轻轻盖上盖子,室温(15–25°C) 下8000 x g (10,000 rpm)离心 15 s清洗柱子,丢弃流出液(含有 QIAzol Lysis Reagent 或 Buffer RWT,不能与漂白剂共存),留着收集管继续第12步。

  • 12

    离心

    吸取500 µL Buffer RPE于柱上。轻轻盖上盖子,室温(15–25°C) 下8000 x g (10,000 rpm)离心 15 s清洗柱子,丢弃流出液。留着收集管继续第13步。

  • 13

    离心

    吸取500 µL 的80% 乙醇于柱上。轻轻盖上盖子,室温(15–25°C) 下8000 x g (10,000 rpm)离心 2 min清洗柱膜。丢弃收集管和流出液。 注意:80% 乙醇须以ethanol (96–100%)和RNase-free water配制。

  • 14

    离心

    将柱子放在一个新的2 mL收集管(提供)上。打开盖子,全速离心5 min,干燥柱膜。丢弃收集管和流出液。 

  • 15

    转移

    将柱子转移入一个新的1.5 ml的收集管(已提供)。加入14 µL RNase-free water于膜中心。小心盖上盖子,1 min下全速离心洗提RNA。最少可加10 µL RNase-free water,用来获得更高浓度的RNA,但是产量会减少20%左右。不要加少于10 µL的RNase-free water,因为柱膜不能得到充分湿润。 柱子的死体积为2 µL:加入14 µL RNase-free water可获得12 µL的洗提液。

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