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1.1.1 瞬时沉默-siRNA

| 1.1.2  瞬时沉默-CRISPRi synthetic sgRNA

实验步骤

  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 1

    溶解

    瞬离siRNA管,以确保siRNA冻干粉沉在管底。用无RNA酶的1x siRNA Buffer或水重悬,例,加500μL 1x siRNA Buffer至10nmol siRNA管中,配制成20μM母液浓度

  • 2

    浓度检测

    瞬离后用紫外分光光度计验证siRNA浓度。(siRNA:1μM=13.3ng/μL)

  • 3

    母液分装

    siRNA溶解后可直接使用,也可等分成更小体积限制冻融次数,-20℃保存

  • 4

    细胞铺板

    最佳细胞密度随生长特性不同而不同,每一种细胞类型需要经验确定。以96孔板DLD-1细胞铺板为例, 5x103个细胞/孔,100μL/孔,37℃过夜培养

  • 5

    转染

    a.  用无RNA酶的1x siRNA Buffer或水将母液稀释至5μM
    b.  在管1中加入9.5μL无血清培养基,0.5μL 5μM siRNA至总体积10μL
    c.  在管2中加入9.5-9.95μL无血清培养基,0.05-0.5μL转染试剂(此处以DharmaFECT reagent为例)至总体积10μL
    d.  轻轻吹打管1和管2,混匀,室温孵育5min
    e.  将管1内容物添加至管2中,总体积20μL, 上下颠倒几次混匀,室温孵育20min
    f.   加入80μL不含抗生素的完全培养基,至总体积100μL
    g.  弃除细胞板中的培养基加入100μL配置好的转染复合物
    h.  37℃,5%CO2中培养24-48h,qPCR检测mRNA水平敲低
    i.   48-96h,WB检测蛋白水平敲低

  • 6

    Tips

    为获取最佳实验结果,转染前后细胞活力需>80%,如果有必要,可在转染24小时后更换培养基降低细胞毒性,继续孵育24-72h进行检测

  • 7

    FAQ

    Q1: 多久可以更换培养基,转染持续时间是多久?
    A1: 培养基可以再转染6h后进行更换,但这不是必需的,整个转染过程是在6h内完成的,基因沉默检测应该在24h后


    Q2: 为什么使用无抗生素的培养基是必要的?
    A2: 推荐整个转染过程中避免使用抗生素,原因是细胞在转染的过程中非常敏感,抗生素会增加细胞死亡。如果必须添加抗生素,也推荐在转染6h后更换含有抗生素的新鲜培养基


    Q3: 转染时siRNA的浓度?
    A3: 由于靶基因的内在特性,不同siRNA的最佳siRNA量可能不同。推荐使用siRNA浓度曲线,范围在5-100nM,找到每个siRNA对应发挥最佳沉默效果的最低使用浓度

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