实验步骤
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溶解
瞬离siRNA管,以确保siRNA冻干粉沉在管底。用无RNA酶的1x siRNA Buffer或水重悬,例,加500μL 1x siRNA Buffer至10nmol siRNA管中,配制成20μM母液浓度
浓度检测
瞬离后用紫外分光光度计验证siRNA浓度。(siRNA:1μM=13.3ng/μL)
母液分装
siRNA溶解后可直接使用,也可等分成更小体积限制冻融次数,-20℃保存
细胞铺板
最佳细胞密度随生长特性不同而不同,每一种细胞类型需要经验确定。以96孔板DLD-1细胞铺板为例, 5x103个细胞/孔,100μL/孔,37℃过夜培养
转染
a. 用无RNA酶的1x siRNA Buffer或水将母液稀释至5μM
b. 在管1中加入9.5μL无血清培养基,0.5μL 5μM siRNA至总体积10μL
c. 在管2中加入9.5-9.95μL无血清培养基,0.05-0.5μL转染试剂(此处以DharmaFECT reagent为例)至总体积10μL
d. 轻轻吹打管1和管2,混匀,室温孵育5min
e. 将管1内容物添加至管2中,总体积20μL, 上下颠倒几次混匀,室温孵育20min
f. 加入80μL不含抗生素的完全培养基,至总体积100μL
g. 弃除细胞板中的培养基,加入100μL配置好的转染复合物
h. 37℃,5%CO2中培养24-48h,qPCR检测mRNA水平敲低
i. 48-96h,WB检测蛋白水平敲低Tips
为获取最佳实验结果,转染前后细胞活力需>80%,如果有必要,可在转染24小时后更换培养基降低细胞毒性,继续孵育24-72h进行检测
FAQ
Q1: 多久可以更换培养基,转染持续时间是多久?
A1: 培养基可以再转染6h后进行更换,但这不是必需的,整个转染过程是在6h内完成的,基因沉默检测应该在24h后
Q2: 为什么使用无抗生素的培养基是必要的?
A2: 推荐整个转染过程中避免使用抗生素,原因是细胞在转染的过程中非常敏感,抗生素会增加细胞死亡。如果必须添加抗生素,也推荐在转染6h后更换含有抗生素的新鲜培养基
Q3: 转染时siRNA的浓度?
A3: 由于靶基因的内在特性,不同siRNA的最佳siRNA量可能不同。推荐使用siRNA浓度曲线,范围在5-100nM,找到每个siRNA对应发挥最佳沉默效果的最低使用浓度