实验步骤
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crRNA溶解
瞬离crRNA, SAM tracrRNA,确保RNA干粉沉于管底,使用nuclease-free 10mM Tris -HCl Buffer pH7.4.(Cat #B-006000-100)进行溶解。例如,将10nmol crRNA溶解至1000μL 10mM Tris -HCl Buffer pH 7.4中,至储存浓度为10μM。轻轻吹打混匀,避免气泡生成
浓度检测
瞬离后用紫外分光光度计验证crRNA浓度。(crRNA:1μM=13.5ng/μL; SAM tracrRNA, 1μM=33.5ng/μL)
母液分装
siRNA溶解后可直接使用,也可等分成更小体积限制冻融次数,-20℃保存
转染
以96孔板,Cas9蛋白+crRNA+tracrRNA化学共转染为例
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a. 第一天进行细胞铺板,确保第二天转染时细胞融合度在70-90%左右
b. crRNA和cas9工作浓度配制:
crRNA+tracrRNA,使用nuclease-free 10mM Tris -HCl Buffer pH7.4稀释至2.5μM工作浓度;Cas9蛋白,使用无血清培养基稀释至2.5μM工作浓度
c. 转染复合物制备:以单孔为例。管1中添加2.5μL 2.5μM crRNA+tracrRNA ,1μL 2.5μM Cas9蛋白,加无血清培养基补足至50μL;管2中加入0.1-0.8μL DharmaFECT Duo,加无血清培养基补足至50μL。室温孵育5min,将管1和管2混合,轻轻吹打均匀
d. 转染:弃除板孔中的培养基,每孔加入100μL的转染复合物
e. 转染14-18h后,用新鲜完全培养基替换转染复合物FAQ
Q1: sgRNA,crRNA, tracrRNA, SAM tracrRNA平均分子质量是多少?
A1: sgRNA=32,327g/mol; crRNA=13,500g/mol; tacrRNA=23,759g/mol;
SAM tracrRNA=33,460.0g/mol
Q2: sgRNA, crRNA, tracrRNA, SAM tracrRNA怎么进行nmol和μg的换算?
A2: 以crRNA为例: (5nmol)(13,500g/mol)(mol/109nmol)(106µg/g)=67.5µg