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1.2.1 瞬时敲除-Synthetic crRNA

| 1.2.2  瞬时敲除-Synthetic sgRNA

实验步骤

  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 1

    crRNA溶解

    瞬离crRNA, SAM tracrRNA,确保RNA干粉沉于管底,使用nuclease-free 10mM Tris -HCl Buffer pH7.4.(Cat #B-006000-100)进行溶解。例如,将10nmol crRNA溶解至1000μL 10mM Tris -HCl Buffer pH 7.4中,至储存浓度为10μM。轻轻吹打混匀,避免气泡生成

  • 2

    浓度检测

    瞬离后用紫外分光光度计验证crRNA浓度。(crRNA:1μM=13.5ng/μL; SAM tracrRNA, 1μM=33.5ng/μL)

  • 3

    母液分装

    siRNA溶解后可直接使用,也可等分成更小体积限制冻融次数,-20℃保存

  • 4

    转染

    以96孔板,Cas9蛋白+crRNA+tracrRNA化学共转染为例

    △点击放大图片

    a.  第一天进行细胞铺板,确保第二天转染时细胞融合度在70-90%左右
    b.  crRNA和cas9工作浓度配制:
    crRNA+tracrRNA,使用nuclease-free 10mM Tris -HCl Buffer pH7.4稀释至2.5μM工作浓度;Cas9蛋白,使用无血清培养基稀释至2.5μM工作浓度
    c.  转染复合物制备:以单孔为例。管1中添加2.5μL 2.5μM crRNA+tracrRNA ,1μL 2.5μM Cas9蛋白,加无血清培养基补足至50μL;管2中加入0.1-0.8μL DharmaFECT Duo,加无血清培养基补足至50μL。室温孵育5min,将管1和管2混合,轻轻吹打均匀
    d.  转染:弃除板孔中的培养基,每孔加入100μL的转染复合物
    e.  转染14-18h后,用新鲜完全培养基替换转染复合物

  • 5

    FAQ

    Q1: sgRNA,crRNA,  tracrRNA, SAM tracrRNA平均分子质量是多少?
    A1: sgRNA=32,327g/mol; crRNA=13,500g/mol; tacrRNA=23,759g/mol; 
    SAM tracrRNA=33,460.0g/mol


    Q2: sgRNA, crRNA, tracrRNA, SAM tracrRNA怎么进行nmol和μg的换算?
    A2: 以crRNA为例: (5nmol)(13,500g/mol)(mol/109nmol)(106µg/g)=67.5µg

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