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1.3.5 CRISPRa-CRISPRa lentivial sgRNA

| 2.1.1  体内专用转染试剂:in vivo-jetPEI

实验步骤

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    稳定转染实验步骤

     

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    1)生成可稳定表达dCas9-VPR的稳转细胞系
    2)CRISPRa lentivial sgRNA质粒制备
    3)慢病毒包装
    4)病毒滴定
    5)慢病毒转导
    6)基因表达分析建议:使用管家基因的表达来规范化靶向基因的表达,进行适当数量的技术重复和适当的对照设置

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    瞬时转染实验步骤

    可直接共转染dCas9-VPR和sgRNA表达质粒

     

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    FAQ

    Q1:最好的确认基因被激活的方式是?
    A1:RT-qPCR


    Q2:CRISPRmod CRISPRa系统是否可以应用于非哺乳动物体系,如果蝇或线虫?
    A2:CRSIPRmod CRISPRa系统是为哺乳动物表达系统设计的,且在哺乳动物细胞中得以验证,目前所有的预制gRNA都是针对人、小鼠基因的激活。如果想要靶向其他物种,需要进行定制,但是不能够预测和保障激活效果


    Q3:CRISPRmod CRISPRa guide RNAs是否可用于其他CRISPRa系统?
    A3:CRISPRmod CRISPRa guide RNAs可以和标准gRNA使用系统,如SunTag兼容,但不能够与使用经适体修饰的gRNA将激活子带到dCas9结合位点的系统,如SAM CRISPRa系统。


    Q4:怎样确定选用的细胞系转导时使用的CRISPRmod CRISPRaLentiviraldCas9-VPR和 sgRNA病毒颗粒用量?
    A4:细胞的成功转导取决于细胞类型、细胞密度、传代数、转导过程中的MOI、慢病毒制备的纯度以及是否添加促转导的试剂(如聚苯乙烯)。可在实验之前用96孔板进行优化,测试最优条件

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