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凋亡可被多种细胞信号激活，如钙稳态失衡、氧化损伤、线粒体损伤、毒素、生长因素和激素刺激等。
细胞凋亡过程大致分为：
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经典的细胞凋亡机制
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外源性信号通路
外源性死亡受体途径开始于特异性死亡受体与配体结合，如FasL（CD95）或TNFR1分别和配体Fas或TNF-α结合，使死亡受体的结构域寡聚化，后募集Caspase-8和衔接蛋白FADD形成死亡诱导信号复合体DISC。
激活的Caspase-8引发后续Caspase级联反应促进细胞死亡，它还能与Bid相互作用激活内源性通路。 -
内源性信号通路
内源性凋亡信号通常激活线粒体途径。
凋亡蛋白Bid诱导凋亡蛋白Bcl-2拮抗剂Bak和Bcl-2结合蛋白Bax的激活，它们形成的聚合体插入线粒体外膜引起膜电位下降和细胞凋亡关键蛋白的释放，如细胞色素C、SMAC/DIABLO及凋亡诱导因子（AIF）等，激活Caspase级联反应，从而诱发细胞凋亡。