视频素材来源于YouTube https://www.youtube.com/watch?v=Ob9xGBPvr_s
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实验步骤
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对于转录因子或辅因子 ChIP-seq，使用至少 5 ng ChIP 富集的 DNA 和 10 个 PCR 循环扩增衔接子连接的 DNA；
对于转录因子或辅因子ChIP-seq，使用至少5ng ChIP富集的DNA和10个PCR循环扩增衔接子连接的DNA；
对于总组蛋白和组蛋白修饰或样品输入对照，开始时使用至少50ng ChIP富集的DNA和6个PCR循环扩增衔接子连接的DNA；
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纯化
要对全部靶标类型的ChIP-富集的DNA构建文库，需对衔接子连接的DNA进行纯化，但无需进行大小选择；
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检验
在构建DNA文库之后，使用Agilent High Sensitivity DNA Kit(Agilent Technologies，货号：G2938-90322)或通过与50-100ng DNA在2%琼脂糖TAE凝胶上进行琼脂糖凝胶电泳，来检验DNA文库中衔接子二聚体(约140bp)是否存在。如果DNA文库中存在衔接子二聚体，则重复PCR扩增材料的纯化；
也可通过对已知阳性和阴性靶基因座使用qPCR和引物组来确认文库的质量。与阴性引物相比，阳性引物对仍然应当产生相同的高信号，如原始qPCR分析ChIP富集的DNA时所见；
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样品制备
完成最终的纯化和质量检验后，制备浓度为2-10nM的最终纯化文库样品以用于高通量测序。