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5.1.1 酶解法 胞核制备

| 5.1.2 酶解法 染色质消化的预实验

准备

取出并预热200×Protease Inhibitor Cocktail(PIC),使用前确保它完全融化。

 

试剂配方

1)    SimpleChIP®SimpleChIP®Plus试剂盒:

    a)    配制1MDTT(192.8mg DTT+1.12 mld H2O),确保DTT晶体完全溶解;

    b)    对于每份IP制备物,制备1ml 1×缓冲液A(250μl 4×BufferA + 750μl水) + 0.5μl 1MDTT+5μl200×PIC并置于冰上;

    c)    对于每份IP制备物,制备1ml1×缓冲液B(275μl 4×BufferB + 825μl水) + 0.55μl 1MDTT并置于冰上。

2)    如果自己配置缓冲液,配方如下:

    a)    裂解缓冲液:

试剂

储液

含量(每60mL

终浓度

HEPES (pH 7.5)

1mol/L

3mL

50mmol/L

NaCl

5mol/L

1.68mL

140mmol/L

EDTA (pH 8.0)

0.5mol/L

120μL

1mmol/L

甘油

100%

6 mL

10%

NP-40

100%

3 mL

0.5%

Triton X-100

100%

0.15mL

0.25%

dH2O

 

46.05mL

 

 

    b)    蛋白质提取缓冲液:

试剂

储液

含量(每50mL

终浓度

NaCl

5mol/L

2mL

200 mmol/L

EDTA (pH 8.0)

0.5mol/L

100μL

1mmol/L

EGTA (pH 8.0

0.5mol/L

50μL

0.5 mmol/L

Tris (pH 8.0)

1mol/L

500μL

10 mmol/L

dH2O

 

47.35mL

实验步骤

  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 1

    重悬

    对于每份IP制备物,将细胞重悬于1ml冰冷的缓冲液A + DTT + PIC中;

  • 2

    孵育

    在冰上孵育10分钟,每3分钟颠倒试管混匀;

  • 3

    离心

    将细胞置于台式离心机中,在4℃下以2,000×g的速度离心5分钟从而沉淀胞核;

  • 4

    重悬

    对于每份IP制备物,移除上清液并将沉淀物重悬于1ml冰冷的缓冲液B + DTT中;

  • 5

    离心重悬

    对于每份IP制备物,重复离心,移除上清液并将沉淀物重悬于100μl1×缓冲液B + DTT

  • 6

    转移

    将样品转移至5ml微量离心管,直至每支试管共装有1ml样品。

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