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7.1 FlowJO V 10.6 流式分析软件简介

6.1 CBA Flex Set操作流程

20世纪90年代由斯坦佛大学专家Mario Roederer等开发。从最初的V1版本到现在的V10版本,经历了和Windows一样长的发展历史。

顶尖免疫学杂志使用率97%

强大的数据分析工具:

FlowJo® is the leading analysis platform for single-cell flow cytometry analysis.

实验步骤

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    FlowJO具有全面专业分析功能

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    FlowJO 专项分析功能丰富

    ◆  补偿调整矩阵
    如果荧光补偿单染对照的数据很好,阳性细胞群和阴性细胞群的分群就很明显。 只需要将单染管的数据导入FlowJo的补偿编辑器里,FlowJO能自动设门,界定除阴性细胞群和阳性细胞群,并计算出荧光补偿矩阵

     ◆  生物分析平台

    细胞增殖的示踪,一般是用CFSE等示踪染料标记细胞,随着细胞分裂代数增加,染料逐步稀释,从而产生每一代荧光强度递减的分布,从而能够方便地分析出细胞增殖代数和比例。以往,Modfit是细胞增殖分析的首选,但现在FlowJO最新版增加了这个分析功能。

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    FlowJO全兼容所有FCS格式文件

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    FlowJO 高质量结果(不同形式输出)

       T-SNE降维分析

    T分布随机近邻嵌入( T-Distribution Stochastic Neighbour Embedding)是一种用于降维的机器学习方法,它能帮我们识别相关联的模式。

    t-SNE主要的优势就是保持局部结构的能力。这意味着高维数据空间中距离相近的点投影到低维中仍然相近。t- SNE同样能生成漂亮的可视化,即“脑图”。

     

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       FlowSOM

     

    流式数据可以通过FlowSOM算法对样本进行多轮聚类分析,然后对不同组样本所包含的各个亚群比例进行

    对比统计分析(如下图)。

     

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