由于引物是根据目的基因序列来设计的,所以查找到目的基因序列是设计引物的第一步。查找目的基因序列可以在多个网站上查到,也可以在文献中查找。
这里介绍的是比较常用的NCBI网站查找基因序列的方法。NCBI是美国国家生物技术信息中心,网站上具有多个生物数据库,是生物学研究常用的网站。
以下对步骤进行梳理,详细操作请查看视频。
实验步骤
- 1
- 2
- 3
- 4
输入基因/蛋白名称
选择对应物种
找到对应物种,也可以选择右侧框中的物种查找;
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点击mRNA and Proteins
页面往下拉,找到mRNA and Protein(s),选择正确的isoform,NMxxx表示mRNA序列,NPxxx表示蛋白质序列;
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查找CDS序列
新页面往下拉,点击CDS,点击右侧FASTA,即可得到目的基因的mRNA序列,复制粘贴到新的文本,以备使用。
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