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目的基因扩增之后,目的基因存在的缓冲体系会影响到之后酶切效果,所以通常先进行目的基因的纯化,也叫作切胶回收。
先进行跑胶,然后进行切胶回收。切胶回收通常也使用试剂盒进行操作,这里参照爱必信的DNA Gel/PCR Purification Kit产品说明书进行介绍。
产品组分:
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实验步骤
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配置琼脂糖凝胶
取50xTAE缓冲液20ml加水至1000ml,配制成1xTAE电泳缓冲液,备用。
称取0.5g琼脂糖,置于200ml锥形瓶中,加入50ml 1xTAE电泳缓冲液,在微波炉里加热至琼脂糖全部融化,取出摇匀。加热过程中要不时摇动,使琼脂糖在溶液中分散均匀。
在制胶槽中插好梳子,向冷却的琼脂糖中加入GelRED染色剂,缓慢倒入制胶槽中。把制胶槽放入电泳仪中,在电泳仪中倒入TAE电泳缓冲液。倒入电泳液,上样
将50ul PCR产物中加入10ul 6x loading buffer并混匀,用移液器小心加入到加样孔中。在旁边的孔中加入核酸Marker。
跑胶并观察
加样完成后,盖上电泳仪盖子,启动电源。电压通常设置为100V,当溴酚蓝指示跑到适合位置时,关闭电源停止电泳。
切胶
将凝胶转移至核酸检测仪中,在紫外灯下快速准确的切下含有目的DNA片段的琼脂糖凝胶块,放进1.5ml离心管中。
DNA吸附柱平衡
DNA吸附柱平衡处理:向Gel Recovery Column中加入 200μl buffer CBS,12000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,将Gel Recovery Column重新放回到收集管中。再向Gel Recovery Column中加入200μl的ddH2O,12000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液。将Gel Recovery Column重新放回到收集管中。
凝胶称重,溶解
从琼脂糖凝胶中切下含有目的片段的凝胶,估计重量或精确称量重量。每100mg 1%琼脂糖凝胶加入100μl Binding Solution。
于50-60℃水浴5-10min,期间每2-3min间断轻微颠倒混匀,直至胶块完全融化。
加试剂,离心
将吸附柱重新放回收集管中,加入500μl WA Solution,于12000rpm离心1min,倒掉收集管中废液。
重复上个步骤一次。
将吸附柱重新放回收集管中,12000rpm离心1min,打开吸附柱盖子,室温放置5-10min或50℃放置3-5min,以彻底去除Wash Solution。加Elution Buffer
将吸附柱放入干净的1.5ml收集管中(试剂盒自带),对于膜中央悬空加入30-50μl Elution Buffer,盖好盖子,37℃放置2min,12000rpm离心1min,离心管中的液体即为包含目的基因的溶液。
检测纯度及浓度
吸光度A260/280比值接近1.8表明纯度较高。