逻辑设门方案
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生物学背景
Mouse脾脏样本的8色T/B/NK/髓系macrophage细胞分型
TBNK细胞的分析是免疫相关研究的基础,识别和表征TBNK细胞可以在项目研究中用作次要或探索性终点,以评估特定药物的免疫相关不良事件或疗效。了解自然疾病进展过程中免疫细胞亚型和各种细胞因子也有助于揭示治疗发展计划中免疫调节的潜在靶点。
巨噬细胞(macrophage)是专门参与检测、吞噬和破坏细菌和其他有害生物的细胞。此外,它们还可以向T细胞呈递抗原,并通过释放激活其他细胞的分子(称为细胞因子)引发炎症。
panel&结果展示
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实验信息
样本类型
Mouse spleen
方案类型
Multicolor panel
实验方案
Surface marker staining
使用的仪器
3-laser,12-color(5 violet/4 blue/3 red)Beckman Cytoflex Flow Cytometer
逻辑设门图&数据结果说明
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图a. t-SNE
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图b. Flowsom
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图c. Heatmap
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图d. Violin Box
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使用8色的多色方案对小鼠TBNK和巨噬细胞进行研究
来自小鼠脾脏单细胞悬液进行代表性分析。首先根据光散射特性去黏连得到单细胞,再通过CD45+细胞门鉴定总白细胞,通过CD11b去圈出CD11b-和CD11b+群,从CD11b+群中通过F4/80圈出macrophage巨噬细胞。在CD11b-群中,通过B220和CD3圈出B细胞和非B细胞;从非B细胞中,通过CD3和NK1.1圈出NK细胞、NKT细胞和总T细胞,再从总T细胞下面,用CD4和CD8去圈出Th细胞和Tc细胞。在3激光12色Beckman Cytoflex Flow Cytometer流式细胞仪上采集样本。使用Flowjo v10软件进行数据分析。降维图和聚类图等使用Flowjo v10软件上的T-SNE、FlowSOM以及Violin插件创建。