逻辑设门方案
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生物学背景
Human外周血样本的8色T细胞分型
淋巴细胞（lymphocyte）是白细胞的一种，其由淋巴器官产生，主要存在于淋巴管中循环的淋巴液中，是机体免疫应答功能的重要细胞成分。根据功能，T细胞可以分为三群：细胞毒性T细胞、辅助性T细胞（Th）和调节T细胞（Tregs）。不同细胞表达的抗原标记物和分泌的细胞因子的差异，为研究T细胞多样化的性质和功能提供了有价值的线索。T细胞被特异性的抗原物质激活后，进行增殖和分化，形成在功能上各异的细胞亚群，包括幼稚，干细胞记忆，中枢记忆，效应记忆和终末分化效应记忆T细胞等。
panel&结果展示
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实验信息
样本类型
Whole blood
方案类型
Multicolor panel
实验方案
Surface marker staining
使用的仪器
3-laser,12-color(5 violet/4 blue/3 red)Beckman Cytoflex Flow Cytometer
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配色方案
激光 标志物 荧光染料 克隆 体积/测试 货号 Blue 488 nm CD4 FITC RPA-T4 10 ul 555346 CD25 PE M-A251 10 ul 555432 CD8 Percp-cy5.5 RPA-T8 2.5ul 560662 CD45RA PE-CY7 HI100 2.5ul 560675 Red 640 nm CD45RO APC UCHL1 10ul 559865 CD45 APC-CY7 2D1 2.5ul 557833 Violet 405nm CD3 BV510 UCHT1 2.5ul 563109 CD127 BV421 HIL-7R-M21 2.5ul 562436 -
逻辑设门图&数据结果说明
图a.t-SNE
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图b.Flowsom
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图c.Heatmap
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图d.Violin Box
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使用8色的多色方案对人全血中T细胞进行研究
来自健康人全血进行代表性分析。首先根据光散射特性去黏连得到单细胞，再通过CD45+细胞门鉴定总白细胞，通过CD3圈出总T细胞。通过CD4和CD8圈出Th细胞和Tc细胞，从Th细胞和Tc细胞下面，分别通过CD45RA和CD45RO结合圈出naïve和memory细胞。从Th细胞下面通过CD25和CD127圈出Treg细胞，再用CD45RA和CD45RO圈出初始Treg和效应Treg，在3激光12色Beckman Cytoflex Flow Cytometer流式细胞仪上采集样本。使用Flowjo v10软件进行数据分析。降维图和聚类图等使用Flowjo v10软件上的T-SNE、FlowSOM以及Violin插件创建。