逻辑设门方案
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生物学背景
Human外周血样本的9色T/B/NK/髓系DC细胞分型
根据其生物学功能和细胞表面抗原表达，人类淋巴细胞可分为三个主要亚群：T淋巴细胞、B淋巴细胞和NK淋巴细胞，而这些淋巴细胞几乎在所有疾病中都有某种作用，因此通过TBNK实时动态监测，可以了解机体的免疫功能状态，从而对异常状态迅速做出反应。
树突状细胞（DC细胞）在天然性免疫系统中识别病原体，在适应性免疫系统中激活免疫细胞。DC细胞还能够分泌细胞因子和生长因子，用于增强并调节免疫反应。树突状细胞在机体局部都有分布，尤其是淋巴器官及表皮系统
panel&结果展示
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实验信息
样本类型
Whole blood
方案类型
Multicolor panel
实验方案
Surface marker staining
使用的仪器
3-laser,12-color(5 violet/4 blue/3 red)Beckman Cytoflex Flow Cytometer
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配色方案
激光 标志物 荧光染料 克隆 体积/测试 货号 Blue 488 nm CD4 FITC RPA-T4 10 ul 555346 CD19 PE HIB19 10 ul 555413 CD8 Percp-cy5.5 RPA-T8 2.5ul 560662 Red 640 nm CD11C APC B-ly6 10 ul 559877 CD45 APC-CY7 2D1 2.5ul 557833 Violet 405nm CD11b BV421 ICRF44 2.5ul 562632 CD3 BV510 UCHT1 2.5ul 563109 HLA-DR BV605 G46-6 2.5ul 562845 CD56 BV650 NCAM16.2 2.5ul 564057 -
逻辑设门图&数据结果说明
图a.t-SNE
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图b.Flowsom
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图c.Heatmap
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图d.Violin Box
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使用9色的多色方案对人全血中TBNK和DC细胞进行研究
来自健康人全血进行代表性分析。首先根据光散射特性去黏连得到单细胞，再通过CD45+细胞门鉴定总白细胞，通过CD11b和SSC圈出CD11b+和CD11blow细胞。从CD11b+SSChi细胞里通过CD11C和HLA-DR圈出DC细胞，从CD11blowSSClow细胞里通过CD3和CD19圈出B细胞和非B细胞。从非B细胞下面通过CD3和CD56圈出T细胞、NK细胞、NKT细胞和lin（CD19-CD3-CD56-），从T细胞下面通过CD4和CD8圈出CD4+Th细胞和CD8+Tc细胞，从lin下面通过在3激光12色Beckman Cytoflex Flow Cytometer流式细胞仪上采集样本。使用Flowjo v10软件进行数据分析。降维图和聚类图等使用Flowjo v10软件上的T-SNE、FlowSOM以及Violin插件创建。