实验步骤
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酶浓度
这一步给出了实验最佳的激酶浓度,即信号达到最大浓度的80%(EC80)。激酶的浓度从0.10ng/孔到10ng/孔,与生物素-底物(1μM)和非限制性ATP浓度(100μM)孵育30min。在EDTA中加入检测试剂后,终止反应。生物素-底物/SA XL665的比例为8/1,即62.2nM SA XL665和Eu标记的磷酸化特异性抗体保持不变。在得到的EC80处选择最佳的酶浓度。如MAPKAP-K2浓度为0.4ng/孔。
图9: MAPKAP-K2浓度
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酶反应时间
使用上述实验中确定的激酶浓度,每孔0.4ng MAPKAP-K2,1µM底物和非限制性ATP浓度(100μM)。通过加入检测试剂在1、2、5、10、15、30和60 min不同时间停止反应。MAPKAP-K2浓度为0.4ng/孔达到最大信号,并选择5 min的线性时间,该孵育时间在接下来优化时间中保持不变。
图10: MAPKAP-K2反应时间
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底物浓度
使用上述酶浓度:0.4ng/孔,孵育时间:5 min,底物浓度从1nM到2μM。在检测步骤中,调整SA-XL665的浓度,使生物素-底物/链霉亲和素-XL665的比值保持在8/1。绘制信号与底物浓度的关系,使用米氏-Menten方程计算得到80nM的KM(app)。
图11: MAPKAP-K2底物浓度
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ATP浓度
酶浓度0.4ng/孔,孵育时间5 min,ATP为1.7 nM至300μM,得到2.3µM的ATP KM(app)。
图12: ATP浓度
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抗体对优化
生物素-底物/SA-XL665比值也是影响信号的因素。该实验使用上述已确定的酶、ATP和底物浓度进行。生物素-底物/链霉亲和素-XL665的摩尔比为2/1、4/1、8/1。
选择原则:
1.信噪比佳;
2.减少所使用的试剂。
图13: MAPKAP-K2生物素-底物/SA-XL665为4/1
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通过上述步骤确定的最终检测体系为,酶浓度:0.4ng/孔,孵育时间:5 min,ATP 2.3µM,底物浓度80nM和生物素-底物/链霉亲和素-XL665的摩尔比为4/1。在此条件基础上,进行下一步抑制剂筛选实验。
抑制剂IC50
微孔板中依次加入4μl Staurosporine,2μl生物素-底物 ,2μl激酶 ,2μl ATP,37℃孵育5分钟后,加入检测试剂各5μl,加盖封板膜,室温静置60分钟。
图14: MAPKAP-K2 Staurosporine IC50:92nM
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综上所述,本实验最终优化体系为:酶浓度:0.4ng/孔,孵育时间:5 min,ATP 2.3µM,底物浓度80nM和生物素-底物/链霉亲和素-XL665的摩尔比为4/1。Staurosporine抑制剂IC50:92nM